#pragma css /css/2011.css
<<BI>>

= Указания к заданию d4-7 =
Пользоваться надо не PDB-записью, а биологической единицей!

== Как изобразить поверхность контакта ==
Для изображения части поверхности объекта, приходящейся на данное множество, в PyMOL используется команда 
{{{
 show surface, <множество>
}}}
Проблема с поверхностью контакта двух частей объекта заключается в том, что эта поверхность не входит в поверхность объекта в целом и упомянутая команда её не покажет.

Поэтому надо действовать так: 1) создать командой `create` новый объект, включающий обе контактирующие части; 2) командой `select` с помощью оператора `around` определить зону контакта на одной из частей; 3) командой remove удалить из объекта другую часть; 4) командой `show surface` изобразить поверхность зоны контакта.

Для красоты командой
{{{
 set transparency, 0.5
}}}

можно сделать поверхность полупрозрачной. Можно также попробовать команду
{{{
 set surface_quality, 1
}}}
(или даже 2 вместо 1).