#pragma css /css/2014.css
<<BI>>

== Команды, полезные для выполнения заданий ==

{{{
label %r # показывает номера остатков при каждом атоме из выделенного множества
label off 
}}}

Для построения ВСЕХ водородных связей, а не только связей между остовными атомами, надо выполнить сначала следующие команды:
{{{
set hbondsRasmol false
@hbondsAngleMinimum = 90     #задает минимум угла водородной связи - см. ваше задание 2 в практ. 1 
@hbondsDistanceMaximum = 3.5 #задает максимальное расстояние водородной связи.
}}}

Водородные связи находятся и изображаются как и раньше:
{{{
select <нужное множество>
hbonds calculate
hbonds 40
color hbonds green  # если хотите чтобы водородные связи были зелеными
}}}  

Могут пригодится такие предопределенные множества атомов
{{{
select charged  # понятно
select ligands  # понятно
select oxygen   # все кислороды
select nitrogen # все азоты
select water    # все молекулы воды
select backbone # все атомы остова полипептидной цепи (без боковых цепей)
}}}