#pragma css /css/2017.css
<<BI>>

= Указания к практикуму 11 =

== Как посчитать число находок ==
Для каждой находки нетрудно выяснить её номер в списке.
В выдаче BLAST (на сайте NCBI) гиперссылки в самом правом столбце (Accession) выглядят примерно так:
`https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/Q6D2N1.1?report=genbank&log$=prottop&blast_rank=12&RID=E19K5HZY014`

В данном случае после "blast_rank=" стоит 12, это и есть номер находки в списке. Сама гиперссылка ведёт на страницу с описанием белка-находки, но номер можно найти в адресной строке браузера.

== Как изменить максимальное число находок или длину слова ==
Перед тем, как запускать BLAST, нужно открыть "Algorithm parameters" (внизу страницы, с которой запускается поиск). Там можно изменить параметры "Max target sequences" и "Word size".

== Как ограничить поиск заданным таксоном ==
Начните набирать название таксона в окошке "Organism" на странице запуска BLAST. В какой-то момент возникнет список, в котором надо выбрать нужный таксон.