#pragma css /css/2021.css <<BI>> === Указания === === 1. и 2. === * На сайте Pfam выберите поиск по ключевому слову. Например, я попробовал слово Endonuclease. Знаю, что среди эндонуклеаз имеются малочисленные семейства. * В полученном списке перейдите по ссылке на страницу какого-нибудь домена. * Нажмите на ссылку sequences, не обращая внимания на то, что число sequences большое - десятки тысяч или больше. * На открывшейся странице смотрите на число последовательностей seed. Хорошо, если последовательностей seed несколько десятков. Если порог сотня немного превышен, то можно попробоват. Тогда первым делом после скачивания в Jalview примените в меню edit опцию remove redundancy. Может поможет уменьшить число последовательностей. * Откройте выравнивание в Jalview и следуйте алгоритму поиска мотивов, описанному в презентации. === 4. === * Можно использовать команду wordcount пакета EMBOSS на kodomo