= Биоинформатика =
== Межфакультетский курс, весна 2025 ==

Факультет биоинженерии и биоинформатики
([[https://yandex.ru/maps/-/CHq55YJI|Ленинские горы, д. 1, стр. 73]]),
ауд. 117, по средам 15:10–16:40

[[https://docs.google.com/spreadsheets/d/1P0VXZOQ0Tai85-mIE6kTKXLf1m4PVdCa_zUQyeElIWM/edit?usp=sharing|Список студентов и результаты проверки заданий]]

{{{#!wiki note
=== Правила зачёта ===
Зачёт "автоматом" получат те слушатели, у которых будет зачтена контрольная по лекции 1 и при этом будет на менее семи зачётных баллов (см. колонку H 
[[https://docs.google.com/spreadsheets/d/1P0VXZOQ0Tai85-mIE6kTKXLf1m4PVdCa_zUQyeElIWM/edit?gid=1267928558#gid=1267928558&range=H1:H85|ведомости]]). Зачётный балл даётся за каждое зачтённое домашнее задание и за каждую зачтённую контрольную. Максимум получается одиннадцать, для автомата достаточно семи.

С теми, у кого не будет автомата, будет проведено собеседование. Время собеседования:
 * для студентов полевых факультетов (т.е, тех, у кого экзамены в мае) — 30 апреля
 * для остальных — '''28 мая'''

Перед собеседованием необходимо будет получить зачёт по контрольной к первой лекции, для этого лучше заранее написать соответствующее [[/cw-1|письмо]]. В крайнем случае перед собеседованием можно будет написать аналогичную контрольную. К самому собеседованию необходимо будет подготовить три рассказа по темам, освещённым в '''трёх разных незачтённых лекциях'''.
Если у вас до автомата не хватило одного или двух зачётных баллов, можно, соответственно, сдать одну или две лекции, из числа незачтённых.

Пересдача будет организована в начале сентября. Те, кому нужна пересдача, пишите С.А.Спирину sas@belozersky.msu.ru
}}}

 

=== Лекция 1. Геномы и что в  них закодировано ===
19 февраля 2025

А.Алексеевский

[ [[https://docs.google.com/presentation/d/1pGJznepFHt3Jyis7Z897Sa1XKFYFVg7E/edit?usp=drive_link&ouid=114112330860244990377&rtpof=true&sd=true|презентация]] ]
[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/L1-Genome-Feb19_2025.pdf|презентация в pdf]] ]
[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/bioinf.pdf|краткое изложение (Глеб Ясиновский)]] ]
[ [[Main/mf_2025s/hw-1|задание на дом]] ]

[ [[Main/mf_2025s/cw-1|способ зачесть КР1 со штрафом за опоздание]] ]

=== Лекция 2. Структура биополимеров ===
26 февраля 2025

А.С.Карягина

[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/Lecture2_2025.pdf|презентация в pdf]] ]
[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/bioinf2.pdf|краткое изложение (Глеб Ясиновский)]] ]
[ [[/hw-2|задание на дом]] ]

=== Лекция 3. Выравнивание биологических последовательностей ===
5 марта 2025

С.А.Спирин

[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/Alignment.pdf|презентация в pdf]] ]
[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/bioinf3.pdf|краткое изложение (Глеб Ясиновский)]] ]
[ [[/hw-3|задание на дом]] ]

=== Лекция 4. Биоинформатика трансмембранных белков ===
12 марта 2025

Д.Диброва

[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/2025_March12_Membrane_proteins.pdf|презентация в pdf]] ]
[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/bioinf4.pdf|краткое изложение (Глеб Ясиновский)]] ]
[ [[/task4|задание на дом]] ]

=== Лекция 5. Биоинформатика и разработка лекарств ===
19 марта 2025

А.С.Карягина

[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/Lecture_5_2025.pdf|презентация в pdf]] ]
[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/bioinf5.pdf|краткое изложение (Глеб Ясиновский)]] ]

=== Лекция 6. Программа BLAST ===
26 марта 2025

С.А.Спирин

[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/BLAST.pdf|презентация в pdf]] ]
[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/bioinf6.pdf|краткое изложение (Глеб Ясиновский)]] ]
[ [[/hw-6|задание на дом]] ]

=== Лекция 7. Сравнение геномов ===
2 апреля 2025

[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/L7-Genome_comparison-2apr2025-aal.pdf|презентация в pdf]] ]
[ [[/hw-7|задание на дом]] ]

А.В.Алексеевский

=== Лекция 8. Секвенирование и базы данных ===
9 апреля 2025

[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/Жарикова_МФК_20250409.pdf|презентация в pdf]] ]
[ [[/hw-8|задание на дом]] ]

А.А.Жарикова

За выполнение задания к лекции 8 будет начисляться два зачётных балла.

=== Лекция 9. Некоторые алгоритмы работы с биологическими последовательностями ===
16 апреля 2025

[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/AlgorithmNW.pdf|презентация 1]] ]
[ [[https://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/mfk/2025s/Gene_prediction.pdf|презентация 2]] ]
[ [[/hw-9|задание на дом]] ]

С.А.Спирин

=== Зачёт для полевых факультетов ===
30 апреля 2025

=== Зачёт для остальных ===
28 мая 2025