Торсионные углы 10-го остатка Mana3_Bacsu

Таблица. Измерение торсионных углов остатка Pro10 в белке Mana3_BACSU, цепь А

Название
двугранного
угла 		Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках – название атома) 		Данный угол описывает
поворот вокруг связи 		Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. THR9:A.C 59 (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
  2. PRO10:A.N 64 (азот пептидной связи между треонином (9) и пролином (10))
  3. PRO10:A.CA 65 (альфа углеродный атом пролина (10))
  4. PRO10:A.C 66 (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
Ni - Cαi -65.05
ψ
  1. PRO10:A.N 64 (азот пролина (10))
  2. PRO10:A.CA 65 (альфа углеродный атом пролина(10))
  3. PRO10:A.C 66 (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  4. VAL11:A.N 71 (азот валина(11))
 Cαi - Ci 148.92
ω
  1. PRO10:A.CA 65 (альфа углеродный атом пролина(10))
  2. PRO10:A.C 66 (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  3. VAL11:A.N 71 (азот валина (11))
  4. VAL11:A.CA 72 (альфа углеродный атом валина (11))
 Ci - Ni+1 178.34

Торсионный угол phi

Второе (левое) изображение показывает проекцию угла фи на плоскость, перпендикулярную связи Pro10:A.N - Pro10:A.Ca

Карты Рамачандрана

Комментарии:
Наиболее частые phi-углы лежат в диапазоне от (-140) градусов до (-60), a psi - от 100 до 180 градусов. В этот же диапазон попадают значения углов бета-тяжей. При чем, значения phi и psi углов пролина, в основном, попадают в диапазон значений углов бета-тяжей. В общем, для всего белка характерны отрицательные значения углов phi и преобладание бета-тяжей.

?