Используя выравнивание 10 последовательностей РНК-зависимых РНК полимераз (RdRP) вирусов из pfam семейства pf00680, созданное в классе, был сделан профиль. C помощью этого профиля осуществлялся поиск по белкам вирусов (файл sw-viruses.fasta). Для дальнейшего изучения выбирались находки с весом, превышающим 1.
На основе полученного результата в Exel была построена ROC-кривая.
Для расчета использовались формулы, приведенные в примере для расчета ROC-кривой.

RdRPНе RdRPВсего
Предсказание RdRP18214196
Предсказание не RdRP27733760
Всего 209 747 956

% ошибок= 4,288
специфичность= 0,98
чувствительность= 0,13