На главную страницу второго семестра

Консервативные аминокислотные остатки в выборке 10 потенциальных ортологов FDHF_ECOLI.

Параметры поиска ортологов.

Матрица попарного сходства ( в % совпадения ) последовательностей выборки 10 потенциальных ортологов FDHF_ECOLI.


               AAB18330.2  NP_110521.1   CAF30854.1  NP_248356.1   CAF29694.1   AF348160_1  NP_815111.1  YP_049610.1  NP_667938.1  YP_049356.1 

AAB18330.2           100%                                                                                                                     

NP_110521.1           36%         100%                                                                                                        

CAF30854.1            36%          44%         100%                                                                                           

NP_248356.1           37%          46%          64%         100%                                                                              

CAF29694.1            34%          42%          64%          62%         100%                                                                 

AF348160_1            32%          41%          57%          57%          75%         100%                                                    

NP_815111.1           40%          29%          33%          33%          34%          31%         100%                                       

YP_049610.1           30%          34%          38%          40%          39%          36%          28%         100%                          

NP_667938.1           29%          33%          36%          37%          37%          34%          28%          72%         100%             

YP_049356.1           28%          33%          35%          37%          36%          35%          27%          67%          66%         100%

Изображение множественного выравнивания выборки 10 потенциальных ортологов FDHF_ECOLI,построенного с помощью прогораммы emma.


Раскраска по степени консервативности:
Абсолютно консервативные аминокислотные остатки - красный
Остатки,консервативные не менее, чем на 80% - синий.

                                                                                                                                                                                                       
                                            *                 2 0                   *                 4 0                   *                 6 0                   *                 8 0              
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   - - - - - - - - M V N L T I D G Q R V T A P E G M T I L E V A R E N G I H I P T L C H H P K L R P L G Y C R L C L V D I E G A A K P M T A C N T P V A E G M V I R   :     7 3
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   M K T K L H T Q T V T L S I D N Q E V T V P K G T T I L E A A K G L G V E I P T L C H L K E L A P D G S C R M C V V E V E G G R R G G L T T A C T A H C Q E D M V   :     8 1
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
                                                                                                                                                                                                       
                                                                                                                                                                                                       
                                          *               1 0 0                   *               1 2 0                   *               1 4 0                   *               1 6 0                
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   T S T P V I E E M R K G I I E M L L S L H P E D C L T C E K A G N C Q L Q D C A Y T Y G V K H G E L P V K R E E L P V L K E N P F I V R D Y N K C I V C G R C V R   :   1 5 4
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   V A T H S E K V A D S R R F I L D L L L S N H K L E C F S C G K N G D C Q L Q Q Y A L D Y G I D V T S F T E G K R M P C H Q E D T S N P F F S Y D P E K C I M C R   :   1 6 2
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
                                                                                                                                                                                                       
                                                                                                                                                                                                       
                                        *               1 8 0                   *               2 0 0                   *               2 2 0                   *               2 4 0                  
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   A C Q E V Q V Q R V V D L V G K G S A A R V G A T K A G A E V S L E E G G C V F C G N C V Q V C P V G A L T E K A G L G Q G R E W E F K K V R S I C S Y C G V G C   :   2 3 5
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M T L T V C P Y C G T G C   :     1 3
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M E L D F I H T I C P Y C G T G C   :     1 7
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M E F K I V N T I C P Y C G V G C   :     1 7
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M T E F K V V H T I C P Y C G T G C   :     1 8
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M T E F K V V H T V C P Y C G T G C   :     1 8
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   R C A R V C Q L R Q G R D V L S I A N R G F E T K M M P S Y G Q A F D Q S I C E S C G N C V S S C P T G A L T A K D T K E Y R K W E T Q K I P T T C P H C G T G C   :   2 4 3
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M Q K V L T V C P Y C G S G C   :     1 5
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M K K I L T V C P Y C G S G C   :     1 5
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M K K I T S V C P Y C G A G C   :     1 5
                                                                                                                                                                        t   C p y C G   G C            
                                                                                                                                                                                                       
                                      *               2 6 0                   *               2 8 0                   *               3 0 0                   *               3 2 0                    
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   N L T L Y V K D G K V V K V R G Y E N P E V N N G W L C V K G R F G F D Y I H N P D R I T R P L I R E G D R E K - - G Y F R E A S W E E A L A L V S Q K L T Q I K   :   3 1 4
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   Q I N V E Y R N G - H F T V H G Y N K S I V N Q G K L C I K G Y Q G L S Y S S S S Q R L N Y P M I R K N - - - - - - G I L T K V T W N E A L D Y V S E K L K T I R   :     8 7
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   G V D L V V K D G T L V G T N P F K R H P V N E G K T C I K G S Y C H E F V H R D D R L K T P L I R K N - - - - - - G E L V E A S W D E A L E L I S G K L Q N Y S   :     9 2
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   G L G L V V K D G R V I G I H P N K R H P I N E G K L C A K G N Y C Y Q F I H S K D R L T K P L I K K E - - - - - - S G F V E T T W N K A L E V I A E N L K T Y K   :     9 2
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   G I D L V V K D G K V V D S H P F K R H P V N E G K V C I K G N Y C Y E F V H S E D R L T K P L I K K N - - - - - - G E F I E A T W D E A L D L I A G K L K Q Y S   :     9 3
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   G I D L V V K D G K L V D T H P F K R H P V N Q G K V C I K G N Y C Y E F V H S E D R L T V P L I R K N - - - - - - G E L V E S T W E E A L D L I A S K L K G Y N   :     9 3
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   Q M N L L V K N N R L V G V E P L D G P A N K N L L C V K G K F A S Y K F V G S G D R L T E P L I K R N - - - - - - G I F E P A S W E E A L T L V S S K F N E I K   :   3 1 8
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   K I N L L V E N G K V V G A E G A N G - V T N E G E L C L K G Y Y G W D F L N D T K L L T P R L K Q P L I R R Q K G A P F E A V S W D E A I G F A S S R L K G I K   :     9 5
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   K L N L L V E D G E I V G A E P A D G - V T N Q G A L C L K G Y Y G W D F L N D T R L L T P R L T T P L L R R Q R G E A F Q P V S W E A A I A F I T A K L S A I K   :     9 5
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   K L K L V V E D N K I I R A E A A D G - V T N Q N E L C L K G Y Y G W D F L N D T Q L L T P R L T Q P M I R Y E K G G R L T P V S W D E A I R Y T A Q R F S E I K   :     9 5
                                l   v     g                           n   g     c   k g           f             l t     l                                   W   e A               l                    
                                                                                                                                                                                                       
                                    *               3 4 0                   *               3 6 0                   *               3 8 0                   *               4 0 0                      
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   G S Y G S E A L G F L C S A K C T N - E E N Y L L Q K L A R G V L G T N N V D H C A R L U H S S T V A G L A T T F G S G A M T N S I A D I A S - A D C I F V I G S   :   3 9 3
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   N K Y G A D A V A F Q S S A K C T N - E E N Y L M Q K I A R - M F G T N N I D H C A R S C H S S T V A G L I K T I G T A A A T G S I K S L K S - T K T Y F I I G S   :   1 6 5
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   P - - - - E E V G F F S S A R C T N - E D N Y V F Q K F A R T V I K T N N V D H C A R L U H S A T V V G L G Q A F G S G A M T N S I S D I E D - A D C I F I I G S   :   1 6 7
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   - - - - - D E I G F F S S A R C T N - E D N Y I L Q K F A R V A L K T N N I D H C A R L X H S A T V T G M S A C F G S G A M T N S I E D I E L - A D C I L I I G S   :   1 6 6
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   P - - - - D E V A F F S C A R G T N - E E S Y A L Q K F A R T V L K T N N V D H C A R I U H A P T V V G L G E C F G S G A M T N S I T D L A Q - A D V L L I Y G S   :   1 6 8
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   P - - - - D E V G F F S C A R G A N - E E S Y A L Q K F A R V V M K T N N V D H C A R I U H A P T V T G L G E C F G S G A M T N S I G D L A E - A D V L F I Y G S   :   1 6 8
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   A E N G P D A L A G F S C S R A T N - E D N Y V F Q K M V R A A F G T N N V D N C A R V C H S A S V H G L A Q T L G S G A M T N P I A D I T E D V D M I L L V G S   :   3 9 8
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   E K Y G A E S I M H T G S S R G P G N E T N Y V M Q K F A R A V T G N N N V D C C A R L C H G P S V A G L Q V T L G N G A M S N S I C E I E K - T D C I L I F G Y   :   1 7 5
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   E R H G P D A I M M T G S S R G P G N E A N Y V M Q K F A R A A I G T N N I D C C A R L C H G P S V A G L Q Q T L G N G A M S N S I G E I E N - T D C I L V F G Y   :   1 7 5
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   A K Y G P R S I M T T G S S R G T G N E T N Y V M Q K F A R A V L N T N N V D C C A R V C H G P S V A G L Q E V L G N G A M S N S I S D I E N - S K C L L I F G Y   :   1 7 5
                                                      r         E   n Y     Q K   a R         t N N   D   C A R     H       V   G l         G   g A m   n s I               d           G              
                                                                                                                                                                                                       
                                  *               4 2 0                   *               4 4 0                   *               4 6 0                   *               4 8 0                        
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   N T T E N H P V I A L K V K E A V R R G A R L I V A D P R R I E L V N F S Y L W L R Q K P G T D L A L L N G L L H V I I K E E L Y D K E F I A Q R T E G F E A L K   :   4 7 4
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   N T T E Q H P I I G T T V L K G K K S G S Y L I V A D P R K T K L A S N A D I F L Q F R P G T D V A L L N S I M F V I L K E N L Y D E E F I K N R T E D F D K L A   :   2 4 6
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   N T F E Q H P L I A R R V V R A K E K G T K I I V I D P R Y T P T A K Q A D L Y L Q L L P G T N I A V L N A I M H V L V K E N L V D E E F I K N R T K G Y E E L K   :   2 4 8
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   N T F E Q H P L I A R R I M R A K D K G A K I I V I D P R R T I T A K N S D I Y L Q I I P G T N V A L I N A M I N V I I K E N L I D K E F I K N R T E G F E K L K   :   2 4 7
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   N T F E A H P L I A R S I V K A K E N G T K I I A I D P R T T H T A K M A D L H L K L I P G S N I D L I N T I T N I I I Q E G M A D E E F I K N R T E G Y D E L K   :   2 4 9
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   N T F E A H P L V A R S I V K A K D N G T K I I A I D P R K T H T S K M A D I H M K L I P G S N I D L M N A I M N V I I T E G L T D D E F I K N R T E N F D E L K   :   2 4 9
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   N P E E A H P V I G A Q I R Q A I Q R G T Q V V V V D P R K I N L V K D S A L H L Q V Q A G T N V A F A N G M M H V I L K E G L A D R H F I E E R T E G F L D L E   :   4 7 9
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   N A A D S H P I V A R R I L K A K A R G A K I I V C D P R R I E T A R I A D L W L P L K N G S N M A L V N A F A N V L I N E G R Y D K A Y V A R H T E G F E E F S   :   2 5 6
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   N A A D S H P I V A R R I L K A K N K G A K L I V C D P R H I E T A R I A D Q W L P L K N G A N M A L V N A F I H V L I E E K L Y D A N Y V R D H T R G F D E L K   :   2 5 6
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   N S A D S H P I V A R R V V K A H Q N G A K I I V C D P R R I E A A R I A D Q H L Q L N N G S N M A L V N A F G Y V L L E E K L Y N Q H Y V D R F T E G L D T Y R   :   2 5 6
                          N         H P     a           a       G       i v   D P R                 d     l         G   n   a l   N         v       E   l   d               T e g       l              
                                                                                                                                                                                                       
                                *               5 0 0                   *               5 2 0                   *               5 4 0                   *               5 6 0                          
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   L A V E E Y T P A K V S E V T G V P A G D I I E A A R T Y A R G P S S T I L Y A M G I T Q H I T G T A N V M A L A N L A M A C G Q V G K E G N G V N P L R G Q S N   :   5 5 5
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   A E I E K Y P P E L T E A I T G V D A E L V R R A A E I Y A K Y K P S A I L Y G M G I T Q H I H G T E N V M S V S N L A L M T G N I G K Y G A G I F P L R G Q N N   :   3 2 7
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   T T L E T Y T P E Y A S K L S G V A P E L I V E A A K M Y G S A N A A S I L Y C M G I T Q F T T G V N N V K S C C N L A M I T G N I G K P G T G V N P L R G Q N N   :   3 2 9
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   E I I K K Y T P E Y A S K I C G V D K E L I I E S A K I Y G N A E R A S I I Y C M G V T Q F T H G V D A V K A L C N L A M I T G N I G K E G T G V N P L R G Q N N   :   3 2 8
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   D V V S K Y T L E K T A E L S G I P A E T I L E A A R M Y G S A E N A S I M Y C L G V T E Y T F G V D N V K S C C N L A M V T G N L G R P G T G V N P L R G Q N N   :   3 3 0
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   E V V S K Y T P E E V A K I S G I P A E T I R E A A R L Y A N A D K A A I M Y C L G V T E Y T F G V D N V K S C C N L A M I T G N L G E R G A G V N P L R G Q N N   :   3 3 0
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   K M V A D Y T P E K V A E I C H I H P E D L I Q A A R M Y A K A E K A P I I Y C L G V T E H S T G T E G V M S M S N L A M L V G K V G K P G C G V N P L R G Q N N   :   5 6 0
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   Q T V A K Y T P E Y V A D I T G L S P K L I R D A M R M Y A A A P S A T I L W G M G V T Q W G Q G V D V V K G L S G L A L L T G N L G R P N V G V G P V R G Q N N   :   3 3 7
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   A G V A A Y R P E D V E P I T G L S A K A V R Q A M R T Y A A A P A A T L L W G M G V T Q W G Q A V D V V K G L S S L A L L T G N L G R P N V G V G P V R G Q N N   :   3 3 7
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   E I V K D Y A P E A V E H L T G V P A A D V R Q A M R T F A A A P S A T I M W G M G V T Q F G Q A V D V V R G L A G L A L L T G N L G R E N V G V G P I R G Q N N   :   3 3 7
                                    Y   p e             g                 a       y     a     a   i         G   T         g       V           L A     t G n   G         G v   P   R G Q n N            
                                                                                                                                                                                                       
                              *               5 8 0                   *               6 0 0                   *               6 2 0                   *               6 4 0                            
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   V Q G A C D M G G L P N V L P G Y Q P V T D P G V R H K - - F S E T W G V P D L P G E P G L T L M E M M A A A Q E G K L K G M Y I L G E N P V L T D P D V S H V K   :   6 3 4
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   V Q G S S D M G A L A E F Y P G Y I P V D S E G V K R - - - - F E D L W K T E L P K K V G L T L S E M F D A A A A G K V K A I Y L M G E N P V I T E A N V A E V E   :   4 0 4
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   V Q G A C D M G A L P N V F P G Y Q A V P A N H E K Y - - - - - A E A W N T C V D - P N V G L S I P D M L A K A G E Q V K C I Y V M G E N P M V S D P D I H H V E   :   4 0 4
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   V Q G A C D M G A L P N V F P G Y Q K V E D G Y K L F - - - - - E E Y W K T D L N - P N S G L T I P E M I D E S G K N I K F L Y I M G E N P I V S D P D V K H V E   :   4 0 3
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   V Q G A C D M G A L P N V F P G Y Q K V G E A Y E R L - - - - - E N L W E T A D L N R E I G L T S P E V L H K A G E Q V K F L H I V G E D P M V A D A D I N H V E   :   4 0 6
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   V Q G A C D M G A L P N V Y P G Y Q K V G E M T S K L - - - - - E E L W G V E G L S P E V G L M G - - - - - - - - - - - - - - - - - - E E K M V A D A D I K K V K   :   3 8 8
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   V Q G A C D M G C M P Y D F P G Y Q K V N N P E V I D K - - - F E K A W H V P L N R N T G L T S T K V L P A A T A G S V K G L Y I F G E D P I V T D P D T G H V R   :   6 3 8
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   V Q G A C D M G A L P N M F P G Y Q N V T D K A V L A K F A D A W G V P - - E L S D K I G Y S L T D L P H K I K E G K I R A N Y V M G E D P L Q T E P D L S M L R   :   4 1 6
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   V Q G A C D M G V L P N T F P G Y E K V T D S E A R A R F A H A W G V A - - E L P A H V G Y S I T D V P H K V A E G K L K A Y Y V F G E D P I Q T E P D L A A M R   :   4 1 6
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   V Q G A C D M G V L P N M F P G Y Q S V T D P D V R A K F A D A W G I S P A V M D E N I G T R I T E V P H M A L E G K I K A Y Y I M G E D P L Q T E A D L S L V R   :   4 1 8
                          V Q G a c D M G   l p n     P G Y q   V                                                                                 k     y     g E   p           d       v              
                                                                                                                                                                                                       
                            *               6 6 0                   *               6 8 0                   *               7 0 0                   *               7 2 0                              
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   E A L K N L E F L V V Q D I F L T E T A R M A D V V L P G A S F A E K E G T F T S T E R R V Q L L H K A I E P P G E A R P D W L I L N D L L L L M G Y - - P R K Y   :   7 1 3
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   K G I E N L E L F I V Q D I F L T E T A S L A D V V L P A A T A L E K D G T F T N T E R R V Q R I V S V K S P P G E A K Q D W W I L S E I A H R L V G - - T E R Y   :   4 8 3
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   H A L K S L D L L I V Q D I F L T E T A Q V A D V V L P G A S W A E K D G T F S N T E R R I Q K I N K A V D S P G E A I A D W K I V K M L A E K M G Q G E L F N F   :   4 8 5
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   K A L K S L D F L V V Q D I F L T E T A K L A D V V L P A A C W A E K D G T F T N T E R R V Q L I R K A V N P P G E A L E D W I I I K K L A E K L G Y G D K F N Y   :   4 8 4
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   K A L K S L D F F V V Q D I F L T E T A K L A D V V L P A A C W A E K D G T F T N S E R R V Q R I R K A V D A P G D A L P D W L I V R K L A E K M G A G E K L N F   :   4 8 7
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   N A L G K L D F L V V K D I F L N D K G K L A D V V L P A A C W A E K D G P F T N T E R R V Q R I R K A V E A P G E A V P D W V V V K E L A Q R M G Y G D K F A F   :   4 6 9
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   Q A L E S L D F L V V Q E L F M T E T A A Y A D V V L P G I S Y A E K D G T F T N T E R R V Q R V R K A V E P R G Q A R E D Y E I F C E V M T R M G Y P - - C A Y   :   7 1 7
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   D A F N E L D L L I V Q D I F M T K T A A I A D V I L P A T S W G E H E G V Y T A A D R G F Q R F Y K A V E P Q G D V K P D W E I I S L M A T A L G Y P - - M H Y   :   4 9 5
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   A A F A A L D L V V V Q D I F M T K T A E L A D V V L P A T S W G E H E G V Y T S A D R G F Q H F N K A I E P K G D V K P D W E I I S L I S T A M G Y P - - M A Y   :   4 9 5
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   R G V E A L D F L V V Q D I F M T K T A E V A D V L L P A T S W G E H G G V F T C A D R G F Q R F E K A I E P K G N V K R D W E I I S L I A S E M G Y P - - M H Y   :   4 9 7
                            a       L d       V q d i F   t   t a     A D V v L P           E     G   f t       R     Q       k a         G         D w   i                 g                          
                                                                                                                                                                                                       
                          *               7 4 0                   *               7 6 0                   *               7 8 0                   *               8 0 0                   *            
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   S S P G E I M Q E I A G L T P S Y A G I T Y E R L E D K - G L Q W P V L S L E H P G T P V L H R E K F S R - - - G Y G Q F Q V V H Y R P P A E E P D E E Y P F L F   :   7 9 0
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   R S V E D V F N E I T Q A I P N Y S G I R Y Q D I Y P T - G K Q W P V N E Q N P D G T E I L H T V K F T R - - - G L G R F Y P V S Y E P P S E I A D A E Y P F I L   :   5 6 0
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   N T A E E V F Q E I A K V T P Q Y A G V T Y E R L G V D - G L H W P C K T C E D P G T P I L H C E K C L T P - D G L G N I F A I D Y A D P D E M A D S E Y P M T L   :   5 6 4
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   N K V E D I F N E I R K V T P Q Y R G I T Y K R L K I D - G I H W P C L D E N H S G T K I L H K D K F L T D - N G R G K I F P V E Y R E V A E L P D K D Y P F I L   :   5 6 3
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   E S A S E I F D E M A K V I P Q Y A G M S F E R L G I D - G L Q W P C K T P E D P G T P I L H K E K F L R P - N G L G K F T P V E H K D A D E L I D E E Y P L I L   :   5 6 6
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   E S A S D I F D E M A K V I P Q Y A G M S F E R L G I D - G L Q W P C K T P D H P G T V F L H E G K F L R P - N G L G K I C P V E H K A P A E M A S E E Y P L I L   :   5 4 8
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   E S A K E I M E E I S A V T P S F G G I N Y E R L E K E - S L Q W P C R S L T D P G T P I M H V G S F A R - - - G K G L F K A I P Y K Q A Q E L P D E E Y P Y L M   :   7 9 4
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   N N T Q E I W D E L R Q L C P L Y Y G A T Y E K M A G L G Y V P W P C P T E D S P G T P W L Y A N N H F D R P G G K G L L L T A E W R P P M E L V D E D Y P L V L   :   5 7 6
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   Q N T Q Q I W D E M R G L C P P F A G V T Y E K L A G L G Y V Q W P C P T E D H P G T P Y L Y T D N Q F A T A D G K G L L S C A P W Q P P H E Q T D S D Y P L A L   :   5 7 6
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   A D N Q Q I W D E M R S L C S L F Y G V T Y E K M G D M G H I Q W P C P T L D H P G T P Y L Y Q D S H F D T P T G K G K L F A T Q W R A P A E V P D E A Y P L V L   :   5 7 8
                                    i     E           p       G     y e                   W P c           p G T     l                     G   G                       E     d     Y P     l            
                                                                                                                                                                                                       
                                        8 2 0                   *               8 4 0                   *               8 6 0                   *               8 8 0                   *              
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   T T G R N L Y H Y H T - V I S R K S R G L E E M C P A P - V V E I N D N D A A R L G I R E G E M I E I V S R R G K V R V K A L V T D R I P R G Q V F M N F H F H E   :   8 6 9
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   T T G R N Y Y H W H S G T M T R R S D I L E R E S P S P - Y V E I S M M D A K Q L N I R D G Q A I D V E S R H G R I T L P A K V T D K I P T G I I F V P F H F K E   :   6 4 0
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   T T G R I I F H Y H T G T M T R R S K H M A D E I N E G - F V E I H P E D A E K M G I K N K Q K V K V S T R R G E V V V N A K I T P N I K Q G V V F M P F H F A E   :   6 4 4
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   T T G R I I F H Y H T G T M T R R C K N L V E E I N E P - F I E I N P D D A K S L K I E N G D L V K V I S R R G E I T A K A R I T E D I K K G V V F M P F H F V E   :   6 4 3
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   T T G R I I F H Y N S G T M T R R C D S I T N E I D E N - F I E I N T E D A K E L G I K P G E K V R V S S R R G T V N A D A R V T E N V I K G V V Y M S F H F L E   :   6 4 6
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   T T G R I I F H Y N S G T M T R R C E S I T N E I D E N - F I E M N I E D A N N L G I K A G E T V K V S S K R G D V K A I A R V S D D I V K G V V Y M S F H F N E   :   6 2 8
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   S T G R M L Y H Y N T R A M T G R T E G I N Q I A N H S - Y I E I N A V D A Q A L G I Q E G D K V E V H S R R G K I E T Y A A V G N R V F P Q E V F M T F H F P D   :   8 7 4
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   C T V R E V G H Y S C R S M T G N C T A L Q T L A D E P G Y V Q V N P H D A E R L G I C D Q Q L V W I S S R R G K V I S R V A V S E R I N K G A V Y M T Y Q W W I   :   6 5 7
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   C T V R E V G H Y S C R S M T G N C G T L K I L A D E P G Y V Q I H P E D A S Y L G V I D Q A L I W I S S R R G K V I A R A S V T E R A N R G A V Y M T Y Q W W I   :   6 5 7
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   C T V R E V G H Y S C R S M T G N C A A L Q A L A D E P G R V Q M H P Q D A N R L G I K D R S L V W V S S R R G K V I S R A D I S E R I N K G T I Y M T Y Q W W I   :   6 5 9
                            T   R       H y         m t                                           D A     l g i                   s r r G           a                 g   v   m                        
                                                                                                                                                         
                                      9 0 0                   *               9 2 0                   *               9 4 0                              
A A B 1 8 3 3 0 . 2   :   A A A N L L T I A A L D P V A K I P I I K P V L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   8 9 3
N P _ 1 1 0 5 2 1 .   :   A R V N L L V G D N L D P Y S K I P E F K V V A A R V I V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   6 6 9
C A F 3 0 8 5 4 . 1   :   T A A N I L T N P A Q D P N C K I P E Y K V C A A K V E K I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   6 7 4
N P _ 2 4 8 3 5 6 .   :   A N P N V L T N T A L D E L C K I P E L K V C A V K I E R I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   6 7 3
C A F 2 9 6 9 4 . 1   :   E A T N K L T N S A Y D P V S K T A E L K I C A V K V E K I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   6 7 6
A F 3 4 8 1 6 0 _ 1   :   E P T N K L T N S A Y D P V S K T R R T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   6 4 8
N P _ 8 1 5 1 1 1 .   :   G N V N E I T N A V F D D I A T I P E Y K V C A V A I K P V N K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   9 0 6
Y P _ 0 4 9 6 1 0 .   :   G A C N E L T L D H L D P V S K T P E Y K H C A V K L E A I D D Q Q A A E N Y V Q - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   6 9 8
N P _ 6 6 7 9 3 8 .   :   G A C N E L T V D H V D P V S K T P E F K H C A V K V E A I S D Q T A A E Q Y V E Q Q Y S Q L K K R L S D A A V V P   :   7 1 5
Y P _ 0 4 9 3 5 6 .   :   G A C N E L T Q D N L D P I S K T P E T K Y C A A K V D V I E D Q R W A E D F A S T S Y N D M K A R L R A A V A H -   :   7 1 6
                                N   l t         D p     k   p e   k     a                                                                                

Картинка 3D-структуры FDHF_ECOLI с отмеченными консервативными остатками.



На картинке изображен лиганд MGD и консервативные аминокислоты из области контакта (расстояние меньше 5 ангстрем )

Из всех аминокислот,находящихся на расстоянии не более 5 ангстрем,консервативными на 100% оказывается только около 25%.
На главную страницу второго семестра