Первый семестр

Описание пространственной структуры ADPP_ECOLI по данным банка PDB, код 1khz

  • Название белка и код в PDB файле — ADP-Ribose Pyrophosphatase, 1khz
  • Метод определения структуры — РСА ( RESOLUTION-2.04 ANGSTROMS)
  • Диаметр белка — 56,04 A , 56,04*10-10 м, 28,02*10 -4 бактерий E.coli

        На рисунке изображен - белок
        ADPP_ECOLI состоящий из двух
        цепей, лиганд ADV
        взаимодействующий с данным
        белком, ионы магния и хлора.
    Скрипт позволяющий выделить аминокислотные остатки белка ADPP_ECOLI взаимодействующие с ADV 
    define cont_B_M within(4.5,adv)
echo vzaimodeistvuushie ostatki
define aa1 79b
echo silnovzaimodeistvuushie ostatki
define aa2 112b
echo slabo vzaimodeistvuushie ostatki