Cхема из Pfam: |
|||||
| Пояснения к схеме Зеленое - Cu-oxidase 3, синее - "low_complexity". |
|||||
| № | Pfam AC | Pfam ID | Полное название семейства доменов (по-русски! и желательно с кратким пояснением) |
Положение в последовательности белка COTA_BACSU | Клан |
| 1. | PF07732 | Cu-oxidase_3 | Семейство доменов названо по названию ферментов Cu-оксидаз, связывающих ион меди и окисляющих его. | 93–179 | Клан CU_oxidase (CL0026), содержит 8 семейств. |
| 2. | PF07731 | Cu-oxidase_2 | - | 358–512 | - |
|
Таксон
|
Количество белков с доменом PF07732.
|
Количество белков с доменом PF07731.
|
|
| Эукариоты | Зеленые растения | 541 | 574 |
| Грибы | 1808 | 796 | |
| Животные | 224 | 210 | |
| Остальные эукариоты | 26 | 22 | |
| Археи | 48 | 27 | |
| Бактерии | 2198 | 1722 | |
| Вирусы | Нет данных | Нет данных | |
Оба домена наиболее распространены у бактерий и грибов.
| № | PFAM ID | Bacillus subtilis |
| 1. | PF07732 | 2 |
| 2 | PF07731 | 2 |
Эти домены редко встречаются в белках Bacillus subtilis.
Домен PF07732 (Cu-oxidase 3) встречается в сочетании с разными доменами, причем бывает как на N-, так и на С-конце последовательности. (На схеме - зеленый блок.)
O53858_MYCTU: 
D2I2Y1_AILME: 
Домен PF07732 (Cu-oxidase 3) встречается в сочетании с разными доменами на нескольких участках последовательности.
Q6P3G1_DANRE: 
CERU_RAT:
Домен PF07731 (Cu-oxidase 2) встречается в сочетании с разными доменами, на разных участках последовательности. (На схеме - фоилетовый блок.)
B1MTT3_CALMO:
B7Z2W0_HUMN: