ID белка | AC белка | Число итераций | Для первой итерации | Для последней итерации | ||||
Число находок выше порога (0,005) | Худшее E-value выше порога | Лучшее E-value ниже порога | Число находок выше порога (0,005) | Худшее E-value выше порога | Лучшее E-value ниже порога | |||
MINC_ECOLI | P18196 | >5 | 162 | 0.005 | 0.006 | 886 | 2e-05 | 0.15 |
SSRP_ECOLI | P0A832 | 2 | 514 | 3e-10 | 5.6 | 514 | 5e-31 | 0.36 |
RP5M_RHIME | P17265 | 4 | 14 | 0.001 | 0.005 | 25 | 9e-15 | 0.14 |
COTA_BACSU | P07788 | 4 | 38 | 0.004 | 0.006 | 134 | 7e-20 | 0.13 |
E-value предыдущих находок с каждой новой итерацией усредняется, сжимается.
В первом случае после каждой итерации добавляются новые последовательности с высоким E-value и разрыв между худшими находками выше порога и лучшими ниже порога не увеличивается. В остальных случаях разрыв увеличивается.
Проведу новый поиск для P18196, изменив порог 0,001. Список стабилизировался на 3 итерации, так как были отсечены последовательности, ослабляющие матрицу.