ID белка AC белка Число итераций Для первой итерации Для последней итерации
Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога
MINC_ECOLI P18196 >5 162 0.005 0.006 886 2e-05 0.15
SSRP_ECOLI P0A832 2 514 3e-10 5.6 514 5e-31 0.36
RP5M_RHIME P17265 4 14 0.001 0.005 25 9e-15 0.14
COTA_BACSU P07788 4 38 0.004 0.006 134 7e-20 0.13

E-value предыдущих находок с каждой новой итерацией усредняется, сжимается.
В первом случае после каждой итерации добавляются новые последовательности с высоким E-value и разрыв между худшими находками выше порога и лучшими ниже порога не увеличивается. В остальных случаях разрыв увеличивается.

Проведу новый поиск для P18196, изменив порог 0,001. Список стабилизировался на 3 итерации, так как были отсечены последовательности, ослабляющие матрицу.