Работа с банком данных Pfam

Описание доменной структуры END4_ECOLI

Изображение доменной структуры а.к. последовательности END4_ECOLI:

Белок содержит всего один домен (идентификатор Pfam — PF01261; сокращенное название — AP_endonuc_2; полное название — Эндонуклеаза IV; положение домена в последовательности а.о 18-239).

Изображение положения доменов в 3D- структуре:

идентификатор PDB — 1qum

Описание семейства доменов, к которому относится N-концевой домен END4_ECOLI (рассматривались домены только из PfamA).
Домен найден в ксилоз изомеразе и эндонуклеазеIV. Также он обнаружен в N-терминальном конце бактериальных белков. Домен вовлечен в катаболизм миоинозитола.
Описание встречаемости белков с доменами AP_endonuc_2 в различных таксонах:

Таксон Количество белков с доменом PF01261

Эукариоты Растения

Грибы

Животные

6

17

12

Бактерии 505

Археи 43

Известно 648 белков с доменами AP_endonuc_2 .
Почти всегда домен AP_endonuc_2 встречается в сочетании с другими доменами.
Случаи дупликации домена, если один из доменов — AP_endonuc_2 неизвестны.
Неизвестны случаи перестановки 2-х доменов местами, если один из доменов - AP_endonuc_2.

На главную страницу второго семестра