 |
На картинке изображена область взаимодействия аденина ADE с белком MTNN_ECOLI, расстояние между которыми равно 3.8 Å. Расстояние определялось при помощи программы RasMol. |
План генноинженерного эксперимента:
1) Список аминокислотных остатков молекулы цепи А, контактирующих с лигандом Аденином: Ile152
(приведено наименование аминокислоты и её номер в цепи).
2) Предложение замены аминокислотного остатка белка, которая может привести к потере
способности связывания цепи А с лигандом: замена ILE152 на пролин.
3) Предложение замены аминокислотного остатка белка, контактирующего с лигандом, но тем не
менее, предположительно, мало влияющей на способность связывания с ним: замена ILE152 на
глицин.
4) Обоснование предлагаемых замен:
а) замены, предложеной в Б): поскольку пролин яляется иминокислотой,
его пространственное расположение в остове белка может расположить
его так, что его остовный атом кислорода не будет взаимодействовать
с аденином.
б) замены, предложенной в В): поскольку водородной связью соединён
кислород изолейцина находящийся в остове, то замена его на аминокислоты,
не содержащие длинных радикалов, не сможет повлиять на связываемость
(кислород в остове во всех аминокислотных остатков располагается на
одном и том же месте) с лигандом.