Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
Фрагмент последовательности | ELFLDLKLHDIPTTVN | 1 | найден лишь мой белок |
Сильный | [RESAQ]-[VLI]-F-[LV]-D-[ML]-K-[FL]-[HF]-D-I-P-[NHTA]-T-V-[AKNG] | 72 | ВСЕ |
Слабый | X-[MLVI]-F-[MLVI]-D-[MLVI]-K-{GA}-[HF]-D-I-P-X-T-V-X(1,2) | 210 | ВСЕ |
Все найденые мотивы принадлежат 1 ферменту в разных организмах.
Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
Например, | ||||||
PS00156 | OMPDECASE | Активный центр фермента | паттерн | [LIVMFTAR]-[LIVMF]-x-D-x-K-x(2)-D-[IV]-[ADGP]-x-T-[CLIVMNTA] | специфична | 1 |
PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | Casein kinase II phosphorylation site | -"- | [ST]-x(2)-[DE] | неспецифична | 6 |
PS00007 | TYR_PHOSPHO_SITE | Tyrosine kinase phosphorylation site | -"- | [RK]-x(2)-[DE]-x(3)-Yor[RK]-x(3)-[DE]-x(2)-Y | неспецифична | 1 |
PS00008 | MYRISTYL | N-myristoylation site | -"- | G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} | неспецифична | 4 |
PS00004 | CAMP_PHOSPHO_SITE | cAMP- and cGMP-dependent protein kinase phosphorylation site | -"- | [RK](2)-x-[ST] | неспецифична | 1 |
PS000094 | AMIDATION | Amidation site | -"- | x-G-[RK]-[RK] | неспецифична | 2 |