Занятие 7

Сбор информации о своем ферменте

Имя Фермента : Оксидаза L-Аминокислот
Фермент : OXLA_HUMAN
EC : 1.4.3.2
1 - Оксидоредуктазы
4 - Взаимодействие с CH-NH2 группой донора
3 - Акцептор -- кислород
2 - Оксидаза L-Аминокислот
Реакция: L-амнокислота + H2O + O2 = 2-оксо-карбоксилат + NH3 + H2O2

Hасколько сохраняется функция фермента у белков со сходными последовательностями?

Всего белков 778, 19 из них имеют тот же подкласс, 15 - тот же подподкласс; только 1 фермент совпал полностью (как ни странно, это OXLA_MOUSE)
e-value - 1
Ближайший из гоологов, 79.22% сходства, O09046 (OXLA_MOUSE); еще два близких гомолога - клеточная и митохондриальная версии белка - 51.72%;
еще 9 с сходством от 40% до 49%
Нижним порогом идентичности, с 90% вероятностью определить достоверный функциональный гомолог, я считал 41%
Таблица