На главную страницу второго семестра

Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Данные банка Swiss-Prot о белке ACRB_ECOLI

Метка поля
(line code)
Запись
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P31224
Стандартное имя последовательности(идентификатор последовательности) ID ACRB_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DE Acriflavine resistance protein B
Белок множественной лекарственной устойчивости ACRB
Дата создания документа DT 01-JUL-1993 (Rel. 26, Created)
Дата последнего исправления аннотации DT 01-FEB-2005 (Rel. 46, Last annotation update)
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности SQ 1049 а.о.
Молекулярная масса белка SQ 113574 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документа RN [8]
Название журнала с самой свежей публикацией RL Science 300:976-980(2003)
Описание вторичной структуры FT
Что содержит поле комментариев? CC Функции, информация о субъединичном строении белка, субклеточная локализация и принадлежность к группе схожих генов.
Какие особенности последовательности указаны? FT Описание трансмембранных участков белка, петель последовательности (и их положение относительно мембраны: Cytoplasmic or Periplasmic), а также их начало и конец.
Идентификатор файла PDB DR 1IWG, 1OY6, 1OY8, 1OY9, 1OYD, 1OYE

Описание белка ACRB_ECOLI в банке данных Swiss-Prot вы можете найти здесь.

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка ACRB_ECOLI

Поиск белков производился с помощью поисковой системы SRS (Sequence Retrieval System).Заинтересовавшиеся могут зайти на сайт SRS..
Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи
(Archaea)
"(((([uniprot-Description:Acriflavine*] & [uniprot-Description:resistance*]) & [uniprot-Description:protein*]) & [uniprot-Description:B]) | [uniprot-Description:Acriflavine resistance protein B*]) & [uniprot-Taxonomy:Archea*]) " 0
Бактерии
(Bacteria)
"((((([uniprot-Description:Acriflavine*] & [uniprot-Description:resistance*]) & [uniprot-Description:protein*]) & [uniprot-Description:B]) | [uniprot-Description:Acriflavine resistance protein B*]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*]) " 11
Эукариоты
(Eukaryota)
"(((([uniprot-Description:Acriflavine*] & [uniprot-Description:resistance*]) & [uniprot-Description:protein*]) & [uniprot-Description:B]) | [uniprot-Description:Acriflavine resistance protein B*]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota*]) " 0

© Яковлев Сергей,2005