Отчет по занятию 12



Таблица. Измерение торсионных углов остатка Phe10 в белке ENDOA_BACSU, цепь А

Название
двугранного
угла
Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках – название атома)
Данный угол описывает
поворот вокруг связи
Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. PHE10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи A)
  2. PHE10:A.CA (alpha-атом углерода 10-го остатка цепи A)
  3. PHE10:A.N (атом азота аминогруппы 10-го остатка цепи A)
  4. TYR9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
N10 - C&alpha10 -78.06
ψ
  1. PHE10:A.N (атом азота аминогруппы 10-го остатка цепи A)
  2. PHE10:A.CA (alpha-атом углерода 10-го остатка цепи A)
  3. PHE10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи A)
  4. ALA11:A.N (атом азота аминогруппы 11-го остатка цепи A)
C&alpha10 - C10 136.04
ω
  1. ALA11:A.CA (alpha-атом углерода 11-го остатка цепи А )
  2. ALA11:A.N (атом азота аминогруппы 10-го остатка цепи A)
  3. PHE10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи A)
  4. PHE10:A.CA (alpha-атом углерода 11-го остатка цепи А)
C10 - N11 172.88


Картинка, иллюстрирующая определение угла phi

Скрипт Exercise12

Карты Рамачандрана





© SHADRINA О. А. 2010