Исследуемая α - спираль
Исследуемые β - тяжи
Количество альфа спиралей - 4
Количество бета-складок - 9
Количество бета-поворотов - 13
В моем белке есть участки с чередованием α и β- структур,
поэтому я бы отнесла его к α/β белкам.
Для исследования выбраны элементы вторичной структуры:
альфа-спираль 96-111
антипараллельная пара бета-тяжей 41-48 и 73-84
параллельная пара бета-тяжей 41-48 и 59-62
бета-поворот 13-23
Паттерн водородных связей Н(i,i+4), β-углероды расположены по спирали и в направлении к N-концу.
Скрипт для альфа-структуры
На картинках изображены три параллельных β-тяжа исследуемого белка. β-углероды выходят перпендикулярно плоскости листа поочередно вверх и вниз.
На картинкe изображен выбранный реверсионный поворот Val 16 - Val 17 - Gly 18 - Ser 19. Присутствует водородная связь.
Цепь А в ленточной модели
Исследуемый реверсионный поворот
