Вторичная структура.

      Общее описание вторичной структуры белка OBG_BACSU цепи A

Количество спиралей Количество β-складок Количество реверсивных поворотов
7 23 30
Вторичная структура белка представлена нечередующимися α и β- структурами, что является признаком α+β белков.

Элементы вторичноой структуры для исследования.


Спираль: ASP253-TYR268
Антипараллельные бетта-тяжи: VAL3-GLY12 and LYS147-VAL157
Параллельные бетта тяжи: VAL239-ILE244 and VAL161-VAL164
Бетта-поворот: ARG24-GLY32

Спираль.


Pattern H(i,i+4)
Бетта углероды расположены снаружи от спирали и направлены к N-концевому участку.
Ссылка на скрипт: Helix

Бетта-складки.


Бетта-углероды расположены поочередно по разным сторонам цепи, перпендикулярно плоскости образуемой тремя тяжами.

Водородные связи параллельных тяжей.

Реверсивный разворот.

Разворот образован последовательностью arg24gly25lys26tyr27val28pro29lys30gly31gly32. В данном развороте нет водородных связей.
© Sliderpro