| Protein Name | ID 1 | ID 2 | Score | % Identity | % Similarity | Gaps | Indels |
| Acyl carrier protein | ACP_ECOLI | ACP_BACSU | 216.0 | 60.3 | 71.8 | 1 | 1 |
| tRNA dimethylallyltransferase | MIAA_ECOLI | MIAA_BACSU | 514.5 | 35.8 | 56.1 | 12 | 6 |
| Zinc uptake regulation protein | ZUR_ECOLI | ZUR_BACSU | 93.0 | 21.0 | 33.7 | 46 | 9 |
| Protein Name | ID 1 | ID 2 | Score | % Identity | % Similarity | Gaps | Indels | Coverage 1 | Coverage 2 |
| Acyl carrier protein | ACP_ECOLI | ACP_BACSU | 216.0 | 61.0 | 72.7 | 0 | 0 | 98.7% | 100.0% |
| tRNA dimethylallyltransferase | MIAA_ECOLI | MIAA_BACSU | 517.5 | 37.4 | 58.0 | 4 | 3 | 100.0% | 98.7% |
| Zinc uptake regulation protein | ZUR_ECOLI | ZUR_BACSU | 104.5 | 25.0 | 42.1 | 14 | 5 | 85.4% | 93.1% |
| Type of Alignment | Protein Name 1 | Protein Name 2 | ID 1 | ID 2 | Score | % Identity | % Similarity | Gaps | Indels | Coverage 1 | Coverage 2 |
| Global | Biotin synthase | Cephalosporin-C deacetylase | BIOB_ECOLI | CAH_BACSU | 53.0 | 16.9 | 28.6 | 162 | 20 | - | - |
| Local | Biotin synthase | Cephalosporin-C deacetylase | BIOB_ECOLI | CAH_BACSU | 61.0 | 19.5 | 33.5 | 95 | 17 | 89.3% | 93.4% |
Это выравнивание показывает очевидных факт, что белки не гомологичные, так как имеет низкий вес, низкий процентный показатель сходства и идентичности, а также больше количество гэпов.
Для этого задания я искала все белки, которые имеют мнемонику "ACP". Полное имя "Cephalosporin-C deacetylase". Таких нашлось 522 штуки. Я наугад выбрала ACP_BRUMB, ACP_PSEMY, ACP_GLUDA, ACP_SHEDO, ACP_HYPNA.
(команды: "infoseq 'sw:ACP_*' -only -name -nohead -out huр.txt" , "wc -l huр.txt")
Для выравнивания я выбрала метод "Muscle with Defaults", окрашивание by "Percentage Identity".
Исходя из результатов выравнивания можно однозначно сказать, что белки гомологичны, так как имеют большие консервативные участки (к примеру, 32-39, а так же менее консервативные: 1-2, 6-11, 41-46, 58-51 и 54-57).