Занятие 8

Задание 1

Фермент: PPOX_HUMAN
KEGG ID: hsa:5498
Метаболические пути:
Pathway
hsa00860 Porphyrin and chlorophyll metabolism(Метаболизм порфирина и хлорофилла)


hsa01100 Metabolic pathways(Метаболические пути)

Задание 2

Лиганды, их ID и структуры:
L-лизин;L-lysine C00047


ацетил-СоА;acetyle-CoA C00024

Задание 3

Карта:
Lysine biosynthesis одно направление Гликолиз ↔ ацетил-КоА → Гомоцитрат → Гомо-цис-ацонитат → Гомоизоцитрат → 2-Оксадипат → L-2-Аминоадипат → LysW-y-L-a-аминоадипат → LysW-y-L-a-аминоадипат 6-фосфат → LysW-y-L-a-аминоадипат 6-симальдегид → LysW-y-L-лизин → L-лизин
(На L-2-Аминоадипате происходит раздвоение пути, вновь соединяется на L-лизине).

Путь

Направление

Возможность выбранной цепочки ферментативных реакций в разных организмах

Организм Цепочка реакций возможна
(да/нет/неизвестно)
Обоснование
Bacillus subtilis да есть все ферменты для синтеза
Archaeoglobus fulgidus да есть все ферменты для синтеза
Arabidopsis thaliana да есть все ферменты для синтеза
Homo sapiens да есть все ферменты для синтеза