задание 1

1. координаты для SPSA_BACSU:1-43
2. P-value для SPSA_BACSU:5.62e-4
3. длина мотива:42
4. E-value:2.5e-057
   b)2 мотив нашёлся во всех последовательностях
   
   1. координаты для SPSA_BACSU:73-114
   2. P-value для SPSA_BACSU:1.99e-36
   3. длина мотива:41
   4. E-value:6.2e-037
      c)3 мотив нашёлся только в 2 последовательностях
      
      1. координаты для SPSA_BACSU:157-206
      2. P-value для SPSA_BACSU:1.41e-58
      3. длина мотива:49
      4. E-value:6.0e-010

         задание 2

         
         Выравнивание программой Muscle
         Результат загрузки meme файла в genedoc
         Вывод: Если сначала говорить о выравнивании с помощью программы muscle,то,к сожалению,большинство гомологов
         белка SPSA_BACSU нашлись при этом только в той же таксономической группе,что и белок.К тому же самое высокое
         значение identity не превысило 40%,так что в белках много несовпадений,а наибольшая консервативная нагрузка пришлась
         на начало последовательности.В этом смысле MEME,в общем-то,ничего нового не показал.Выравнивание мотивов пришлось
         как раз на те участки,в которых произошло наибольшее совпадение.Интересных наблюдений,например выравнивания мотивов,
         стоящих в разных участках последовательностей,я не отметил.

         задание 3

         Mast
         Программа выдала только те последовательности,которые я сравнивал,хотя я поставил низкий порог вхождения.Из-за этого каждый из мотивов нашёлся.
         Mast
         Почти во всех белках нашёлся только 2 домен,тогда как 3 и 1 встречались в единичных случаях,но те,что были располагались в том же порядке,что и в выравнивании. Всего последовательностей очень много,так что бесполезно перечислять