ID белка AC белка Число итераций Для первой итерации Для последней итерации
Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога
MINC_ECOLI P18196 4 248 9.5 5e-133 112 9.9 8e-66
SSRP_ECOLI P0A832 3 16 9.2 9e-90 24 8.7 1e-60
RP5M_RHIME P17265 5 328 9.6 4e-109 147 9.9 1e-49
SPSA_BACSU P39621 - - 1e-150 - - 3e-72
Вывод:
В моём случае итеративный список 3 из 4 белков(все кроме 1) не сашёлся даже после пяти попытокю.
В случае моего белка даже не выводился список белков с e-value выше порга.Возможно,проблема заключется в
несовершенстве программы либо в той самой "вшивой овце".Что касается огромного разрыва в значениях
E-value между худшим и лучшим результатом,то тут можно сослаться на наличие непроверенных признаков сходства
таких как наличие похожих доменов(например,участок предкового гена) или сходных пространственных структур,
которые косвенн позволят судить о сходстве белков,но не дают никакой достоверной информации.Возможно есть участки,
портящие последовательность

Задание2

При ужесточении требований к значению E-value в случае с SSPR_ECOLI поиск стабилизировался после 2 итерации.
Для PP5M-RHIME поиск стабилизировался после 3 итерации.Если говорить про SPSA_BACSU,то поиск стабилизировался
после 3 итерации.Возможно,с сужением области значений случайные последовательности отсеиваются.