seq1	D	N	-	R	V	R	F	Y	Q	S	-	D	I	-	S	G	V	K	-	E	R	T	E	K
seq2	D	K	L	R	V	R	F	Y	Q	S	G	D	I	V	S	-	V	K	K	E	-	-	E	K
Вес	6	0	-12	5	4	5	6	7	5	4	-2	6	4	-2	5	-12	4	5	-2	5	-2	-2	5	5

Вес выравнивания-45



Веса выравниваний,посчитанных вручную и с помощью программы,отличаются довольно значительно.
Результат самостоятельного подсчёта=45,тогда как программа stretcher=34.



a)2-251
b)локальное выравнивание совпадает с глобальным
c)выравнивания имеют разный вес,и глобальное выравнивание весит меньше(189.5) чем локальное (195.5).По видимому,это
связано с тем,что глобальное выравнивание имеет больше гэпов и вытекющий из этого больший штраф,а ,значит,и меньший вес
Needle
Water




Dotmatcher
Карта локального сходства