Множественные выравнивания

Задание1

Выравнивание вирусных белков дельта-антигенов
красный-консервативные остатки
синий-на 80% консервативные остатки
болотный-в меньшей степени консервативные остатки
чёрный-неконсервативные остатки
большие буквы-аминокислотный остаток,входящий в полностью консервативный участок(консервативный остаток)
маленькие буквы-аминокислотный остаток,входящий в частично консервативный участок
цифры над выравниванием-периодическая маркировка положения участка в выравнивании(номер столбца выравнивания)
цифры под выравниванием-функционально консервативная позиция звёздочки-?

Задание2

выравнивание белков гомологичных SPSA_BACSU

Как ни странно,но BLAST при поиске по всему swiss-prot с заданными ограничениями выдал спиок гомологичных белков с очень резким
скачком в % идентичности:самый высокий % после неподходящих 100-это 46%.Но степень сходства 30% всё равно очень низкая,так что я
включил в выборку тоьлко последовательности с % идентичности не ниже 30% и не включил выравнивание с % идентичности 100%

положение функционально консервативных позиций

1)S(9 столбец;остатки 6,8,8,9,7. 27 столбец;остатки 24,26,26,27,25.45 столбец;остатки 42,44,44,45,43)
2)N(17 столбец;остатки 13,15,15,16,14.)
3)D(42 столбец;остатки 39,41,41,42,40.43 столбец;остатки 40,42,42,43,41)
4)R(64 столбец;остатки 58,61,62,62,60)
5)L(29 столбец;остатки 26,28,28,29,27.61 столбец:остатки 85,81,82,82,80.113 столбец;остатки 107,103,104,104,102)