SPSA BACSU


Spore coat polysaccharide biosynthesis protein spsA

протеин,синтезирующий споровую оболочку полисахарида

Главная страница

Информация о белке

идентификаторы в разных базах данных

  1. Uniport ID:SPSA_BACSU
  2. Uniport AC:P3961
  3. PDB ID:1QGQ

Число аминокислотных остатков

256

Names and origin

  1. Рекомендованое название:споровая оболочка биосинтезипующего протеина
  2. название гена: spsA
  3. заданное название локуса: BSU37910
  4. названия ОСТ: ipa-63d

Организм Bacillus subtilis [Законченный протеом] [HAMAP]

таксономический определитель:1423 [NCBI]
таксономическая линейка: Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Bacillaceae › Bacillus

атрибуты протеина

  1. длина последовательности:256 AA.
  2. статус завершённости последовательности:завершённый
  3. функция:гликотрансфераза ,включённая в синтез споровой ободочки.
  4. путь биогенезиса:полисахарид споровой оболочки.
  5. структкра на субуровне:мономер.
Домен содержит Н терминальный нуклеотид связывающий домен и С-терминальный связывающий акцептор домен.
соответстыие последовательностей: принадлежит к семье гликолизтрансферазы 2,

Онтология

Ключевые слова
  1. молекулярная функция:гликолизная трансферазв
  2. Трансфераза
  3. PTM Дисульфидная связь
  4. законченный протеом
  5. Онтология гена
  6. молекулярная функция:трансферазная активность,перенос гликосильных групп
  7. Подразумеваемая из электронной анотации. Источник: UniProtKB-KW
Молекулярная обработка
цепь 1-256 256.биосинтезированный протеин споровой оболочки
PRO_0000059219 Позиция
Активня позиция 191 1 Потенциал

Аминокислотные модификации

  1. Дисульфидня связь 155 - 243
  2. Вторичная структура 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256

Последовательности

CDS Совокупность(3890922..3892346)
/Начало кодона=1
/transl_table=11
/ген="spsB" /тэг локуса="BSU37900"
/продукт="предполагаемая dTDP гликозил/гликосерофосфат трансфераза"
/функция="16.5: Исследование"
/функция="16.8: зацита"
/функция="16.13: форма"
/помечание="свидетельство 3:Функция,предложенная на основании присутствия сберегающего амино кислотного мотива ,структурного признака ограниченной гомологичности; Тип продукта: предполагаемый фермент /db_xref="GOA:P39622"
/db_xref="InterPro:IPR007833"
/db_xref="SubtiList:BG10610"
/db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:P39622"
/inference="ab initio prediction:AMIGene:2.0"
/protein_id="CAB15816.2"

Формат фаста

>SPSA_BACSU Spore coat polysaccharide biosynthesis protein spsA
MSAYLSNYWVLYRKYVELFDKLRYKGIPLGLISNFYQYISPELRV
MMEEEPELFGSVDQHIDEGQIQPFFEERIQNIVKTNDEPVKGKVILHFDYLRFSNENYY
QFDPEKTAVLARWSLPHYCDLPVISKREIADSCQKGDSKQYLETACSLLAPYDDHPAFG
DQAFRDRLFKDIPLFIEAIDTVDALFEQEKISAVIVGTAEDIYSRVLALMCQRKGAVSI
CLQHGALMGDEAFIPVFTTYQAVFGAYEAEWFIRKGCKPEQILVTGHPRFDQIFNRTPM
DMSIFYRKLAFQPTKKIVLIATQPFSEDFYSGVLQGLSDQKQLQIIIKPHPWEIGKNKL
DLYHEAAKKHQACRVIKKELELYDLLPYVDAAVTQTSTVGLEAMLFQKPVLIGKSSGNR
SYPYYESLGDFMFDQPDELAHTLVEVLRSPDVHQKAEEARLAFIAANYPVAESTNALFA
ELKAKTGVDYRREDTE
ген Совокупность <3892351..3893121)
/ген="spsA" / тэг локуса="BSU37910"
Организм-носитель:Bacillus sutilis