Практика 12. PSI-BLAST.

ID белка AC белка Число итераций Для первой итерации Для последней итерации
Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога
MINC_ECOLI P18196 5 не хватило 162 0.005 0.006 886 2e-05 0.15
SSRP_ECOLI P0A832 2 514 3e-10 5.6 514 5e-31 0.36
RP5M_RHIME P17265 4 14 0.001 0.005 25 9e-15 0.14
PUR1_BACSU P00497 5 не хватило 220 0.004 0.008 1933 0.004 0.006

Список стабилизировался за три итерации. Потребовалось меньше итераций, так как были более строгие критерии отбора. Если поставить меньший порог, то первый не вошедший в список на последней итерации может в него войти, так как его E-value=0.001

На главную


©Tsepkova Polina