Занятие 8

Зелёным цветом обозначены 100% консервативные, светло-зелёным с более 80% консервативностью, желтым - боле 60%, остальные - белые.

Цифры и звездочки сверху блоков обозначают четные и нечетные столбцы выравнивания соответственно, цифры в конце строки - номер последней а.к. последовательности на этой строке. Большая буква внизу означает, что на этой позиции стоит только такая аминокислота, Маленькая буква - позиция малоконсервативна, но преобладает эта а.к., цифра - консервативная позиция с разными а.к.

Выравнивание

Достаточно консервативные участки:

27-82 в выравнивании, 12-64 в белке

98-118 в выравнивании, 79-99 в белке

127-165 в выравнивании, 108-146 в белке

192-221 в выравнивании, 167-196 в белке

255-270 в выравнивании, 205-220 в белке

337-371 в выравнивании, 246-280 в белке

471-516 в выравнивании, 316-359 в белке

522-595 в выравнивании, 360-433 в белке

1-24, 222-235, 241-254, 271-302, 315-336, 420-464, 599-639, 653-686 не имеют биологического смысла

Функционально консервативные позиции образованы аминокислотами: EQ, IVLM, KR, WYF, TS, DN.

После добавления новой группы сходных а.к. появились отдельные консервативные позиции:65(48), 311(230), 383(286).

На главную


©Tsepkova Polina