| seq1 | – | T | E | T | E | M | I | V | – | A | L | D | P | N | G | L | R | P | L | S | I | G |
| seq2 | S | T | E | T | E | M | I | Y | T | A | L | T | C | – | G | L | A | P | L | Y | I | V |
| Вес | -12 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | -1 | -12 | 4 | 4 | -1 | -3 | -12 | 6 | 4 | -1 | 7 | 4 | -2 | 4 | -3 |
Вес выравнивания: 14
Выравнивания не совпали, вес выравнивания, выданный программой равен 26
Белки
а)В частичное выравнивание вошли участки 18-479 из PUR1_RHIET и 8-460 из PUR1_BACSU
б)Совпадает
в)Вес полного выравнивания: 1041.5, частичного:1060.0. Вес частичного будет не меньше полного, так как полное оштрафуют за счет кусков, не вошедших в частичное.