| Бактерия | АС | Координаты |
| BACAN | AE016879 | 9335-10841 |
| BACSU | AL009126 | 635433..636987 |
| CLOB1 | CP000726 | 9282-10783 |
| STAA1 | AP009324 | 531922-533476 |
| STAES | AE015929 | 1598006-1599559 |
| STRP1 | AE004092 | 17170-18504 |
| STRPN | NR_028665 | Найдена BLAST |
Выравнивание построено программмой muscle, для построения дерева использована программна fdnaml
Программа выдала дерево, совпадающее с правильным, так как рРНК сильно консервативна.
Задание 4.2
Были использован blastp для поиска гомологов CLPX_BACSU. Последовательности были выровнены c помощью muscle; дерево построено с помощью fprotdist и fneighbor.
Ортологи:
1. Белки CLPX
2. Белки HSLU
Паралоги:
1. CLPC_STAES, HSLU_STAES, CPLX_STAES
2. CLPX_STRPN, FTSH_STRPN
3. HSLU_BACSU, CLPX_BACSU