Задание 1
Были даны последовательности десяти РНК-зависимых РНК полимераз (RdRP) вирусов из pfam семейства pf00680. Они были выровняны и был взят участок для построения профиля. jar
На основании выравнивания был построен профиль
C помощью этого профиля осуществлялся поиск по белкам вирусов. Для дальнейшего изучения выбирались находки с весом, превышающим 1. На основе полученного результата в Exсel была построена ROC-кривая по формулам, приведенным в примере для расчета ROC-кривой.
| RdRP | Не RdRP | Всего | |
| Предсказание RdRP | 166 | 0 | 166 |
| Предсказание не RdRP | 3 | 211 | 214 |
| Всего | 169 | 211 | 380 |
% ошибок=4.45%
специфичность=100%
чувствительность=79.4%
