Заданный фрагмент из BaliBase:

TRPC_METTH  92  FHGSIEFLREASEyg......ipLLM
TRPC_PHYPR  74  FKGSLDDMMEAREvvegmsqrpaILR
TRPC_HALVO  93  FGGSAESLRRIREavd.....vpVLR
TRPC_ACIAD  94  FQGADENIAIARQhcs.....lpALR

Сравнение:
	И
Изображения выравниваний аминокислотных последовательностей белков TRPC_METTH, TRPC_PHYPR, TRPC_HALVO, TRPC_ACIAD. Совпадающие столбцы выделены зеленым цветом. "Биологически неправильные" столбцы выделены бледно-желтым. Синим выделены аминокислотные остатки, почему-то не совпадающие в последовательностях BaliBase и взятые в базе данных Swiss-Prot

Результаты:
В фрагменте множественного выравнивания длиной 25 аминокислотных остатков — 60% биологически правильных колонок. Все они совпадают в выравнивании BaliBase и ClustalW. НО есть один странный факт: в белке TRPC_METTH из PDB-выравнивания некоторые аминокислоты иные, нежели в последовательности. По всей видимости, это произошло потому, что при рентгено-структурном анализе эти аминокислотные остатки просто были неправильно определены.