Описание ГТФ-циклогидролазы FolE2 из генома бактерии Nitrosomonas europaea ATCC 19718.
Здесь собраны данные о выданном мне белке
Таблица с основной информацией о белке
В таблице 1 оформлено то, что я узнала о ГТФ-циклогидролазе FolE2 из генома бактерии и кодирующем этот белок гене, во время выполнения прошлого практикума.
| Идентификатор белка | CAD85074.1 |
|---|---|
| Идентификатор генома | AL954747.1 |
| Название белка | ГТФ-циклогидролаза FolE2 |
| Координаты гена в геноме | 1262582..1263388 |
| Длина гена (п.н.) | 807 |
| Цепь | Прямая |
| Длина белка (а.о.) | 268 |
Информация о геноме бактерии, синтезирующей выданный мне белок, была скачана с сайта NCBI, затем в полученном файле я нашла последовательность своего белка и информацию о нём. скачать Fasta-Файл с последовательностью белка
Последовательность белка:
>CAD85074.1 DUF198
MNKQIDLPIADVQGSLDTRHIAIDRVGIKAIRHPVVVADKGGGSQHTVAQFNMYVNLPHN
FKGTHMSRFVEILNSHEREISVESFEEILRSMVSRLESDSGHIEMAFPYFINKSAPVSGV
KSLLDYEVTFIGEIKHGNQYSFTMKVIVPVTSLCPCSKKISDYGAHNQRSHVTISVRTNS
FIWIEDIIRIAEEQASCELYGLLKRPDEKYVTERAYNNPKFVEDIVRDVAEVLNHDDRID
AYIVESENFESIHNHSAYALIERDKRIR
ГТФ-циклогидролаза — фермент, катализирующий первую реакцию в метаболическом пути биосинтеза тетрагидрофолата,
в результате которой ГТФ превращается в промежуточное соединение (7,8-дигидронеоптеринтрифосфат).
Тетрагидрофолат, в свою очередь, является важным коферментом для метаболизма аминокислот и нуклеиновых кислот.
(Информация взята отсюда). На Рисунке 1 можно увидеть 3D-модель изучаемого белка.
Геномное окружение белка
По координатам гена выданного мне белка я нашла интересующую меня область генома, включила режим просмотра рамок считывания (Six Frames Translation) и получила изображение геномного окружения гена, отвечающего за синтез рассматриваемого белка. На рисунке 2 приведено геномное окружение данного белка, то есть гены, окружающие ген, кодирующий его, и продукты их трансляции.
Ближайшее геномное окружение моего белка - гены белков CAD85073.1 (функция неизвестна) и CAD85075.1 (мембранный белок, предположительно трансмембранный переносчик).