Мембранные белки

Выбранный объект - CCR5 Chemokine Receptor. В курсовой работе этого года я имела дело с комплексом MHC и пептида, принадлежащего ВИЧ, поэтому для выполнения практикума я начала искать белки, связанные с ВИЧ и клеточной мембраной. Очевидный выбор - рецептор, который отвечает за попадание вируса в клетку.
Это человеческий белок, кодируемый одноимённым геном, расположенным в коротком плече 3 хромосомы. Относится к рецепторам бета-хемокинов и классу интегральных мембранных белков. Является белком адгезии и рецептором, сопряжённым с G-белком. Синтезируется преимущественно Т-клетками, макрофагами, дендритными клетками и клетками микроглии. Вероятно, участвует в возникновении воспалительной реакции. Широко известна мутация в гене рецептора - делеция части гена (32 пар оснований), гомозиготные по этой мутации люди невосприимчивы к ВИЧ-1.

Изображение структуры рецептора CCR5.
Трансмембранные участки, предсказанные THMM.
У белка 6 трансмембранных участков, между которыми расположены либо внутриклеточные, либо внеклеточные участки. Белок 6 раз пронизывает мембрану, имеет альфа-спиральную структуру, начало и конец белковой последовательности расположены вне клетки. Четыре трансмембранных участка находятся очень близко друг к другу, а остальные два чуть дальше, между последним и предпоследним довольно продолжительный внутриклеточный участок.
Изображение рецептора, расположенного в мембране.