Молекулярное моделирование биополимеров

1. Знакомство с PyMol
2. Работа в PyMol
3. Семи-эмпирические вычисления: MOPAC
4. Abinitio вычисления для нафталина и азулена
5. Вычисление параметров для молекулярной механики
6. Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики
7. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS
8. Анализ результатов плавления ДНК в формамиде
9. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
10. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
11. Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка.