Первый семестр
Исследование стрруктуры аминокислот и пептидов в программе
ACD ChemSketch
-
Alanine
На рисунке показаны структурные формулы (слева направо):
плоскостная формула третьей аминокислоты белка Thim_Bacsu - Alanine (аланин),
формула D-alanine,
формула L-alanine.
- Пространственная структура L- и D-изомеров аланина:
|
|
D-alanine |
L-alanine |
Из плоскости N-Cα-C у L-аланина выходит атом H, а у D-аланина CH3группа
Отличие этих двух изомеров заключается в следующих пунктах:
- в расположение атомов при αС относительно плоскости N-Cα-C;
- при прохождении плоскополяризованного света через один из изомеров
плоскость поляризации света отклоняется влево, в случае с другим изомером - вправо;
-
L-изомер синтезируется в живых организмах и используется для построения белковых
молекул (D-изомер синтезируется и используется для потроения белковых молекул небольшой группой бактерий).
-
Химическая реакция образования дипептида:
-
Схема пептида
-
Формула фикоцианобилина
Все построения проведены в ACD ChemSketch, которые можно посмотреть в amino.sk2
©Анисенко Андрей