ГЛАВНАЯ СТРАНИЦА
Второй семестр

Множественное выравнивание последовательностей

  1. Muscle и GeneDoc

    2. При помощи пакета программ установленных на сервере kodomo-count.fbb.msu.ru я получил аминокислотные последовательности вирусных "малых дельта-антигенов". воспользовавшись командой Muscle получил их выравнивания.
    delta.fasta - последовательности а.о. малых дельта антигенов, до выравнивания
    Ниже на картинках приведена часть выравнивания данных последовательностей. Как видно при просмотре выравнивания в fasta-формате в FAR Manager мы не можем сделать никаких выводов, относительно сходства или отличия данных аминокислотных последовательностей. помимо того, что невозможно выделить цветом консервативные позиции, выровненные последовательности просто записаны подряд и не приводится сопоставление с остальными последовательностями(в отличии от GeneDoc, в котором выровненные последовательности распологаются друг под другом)|т.е.FAR Manager абсолютно непригоден для анализа выравниваний|
    FAR Manager GeneDoc

    Файлы можно просмотреть пройдя по ссылке:
    delta_aligned.fasta (выравнивание в fasta-формате)
    delta.msf(выравнивание в msf)
  2. Выравнивание набора гомологов THIM_Bacsu

    3. Выравнивание гомологов моего белка можно посмотреть в файлах
    myproteins1.fasta(выравнивание в fasta-формате)
    ANISENKO_prot.msf(выравнивание в msf)
  3. Дополнителные зедания