Описание генома Swine vesicular disease virus strain HК’70
(Вирус свиной везикулярной болезни штамм HК’70)
Рис.1. Swine vesicular disease virus.
Рисунок взят с сайта http://www.sciencephoto.com/media/468625/view
По типу носителя генома вирус классифицируется
как ssRNA positive-strand viruses. Это значит, что вся информация содержится на одноцепочечной РНК положительной полярности, т.е транслируется
та РНК, которая входит в состав вируса. Вирус является возбудителем высокозаразной везикулярной болезни, поражающей свиней (также были зафиксированы
редкие случаи заболевания людей). Впервые был выделен и изучен в 1970 году в Гонконге, в Китайской Академии сельскохозяйственных наук. Вирус имеет
сферическую форму (см. рис.1). Идентификатор записи в базе данных NCBI - AY429470.
Геном этого вируса состоит из одной молекулы РНК
(6558 пар нуклеотидов). В геноме закодирован один ген
(см. таблицу 1), который кодирует один полипротеин (идентификатор в базе данных GenBank:
AAR06974.1).
Таблица 1. Ген в геноме Swine vesicular disease virus
| № | Начало | Конец | Направление | Длина |
| 1 | 744 | 7301 | Прямая цепь | 7301-744 +1=6558 |
Длина гена делится на 3, так как нуклеотиды входят в состав триплетов, кодирующих аминокислоты, а в каждом триплете по 3 нуклеотида. Его графическое изображение показано на рисунке 2, а 5’-концевая область на рисунке 3.
Рис. 2. Расположение гена в геноме swine vesicular disease virus . Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
Рис. 3. 5’-концевой фрагмент гена (начальный участок). Первый кодон – ATG, который соответствует аминокислотному остатку метионина (M). Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
| © Амосова Алена. 2013 год | Дата последнего изменения: 21 декабря 2013. |