Практикум №1. Построение филогенетического дерева.

Отобранные бактерии

Название Мнемоника NCBI Taxonomy
Arthrobacter sp. ARTS2 Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Micrococcaceae; Arthrobacter;
Bifidobacterium longum BIFLO Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Bifidobacteriales; Bifidobacteriaceae; Bifidobacterium
Corynebacterium efficiens COREF Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium
Leifsonia xyli LEIXX Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Leifsonia
Mycobacterium leprae MYCLE Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium
Nocardioides sp. NOCSJ Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Propionibacteriales; Nocardioidaceae; Nocardioides;
Thermobifida fusca THEFY Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Streptosporangiales; Nocardiopsaceae; Thermobifida

Скобочная формула

((((ARTS2, LEIXX), BIFLO), (THEFY, NOCSJ)), (MYCLE, COREF));

Изображение дерева

photo

Нетривиальные ветви дерева

  • {ARTS2, LEIXX} против {BIFLO, THEFY, NOCSJ, MYCLE, COREF} - определяемая группа: Micrococcales
  • {ARTS2, LEIXX, BIFLO} против {THEFY, NOCSJ, MYCLE, COREF}
  • {THEFY, NOCSJ} против {ARTS2, LEIXX, BIFLO, MYCLE, COREF}
  • {MYCLE, COREF} против {ARTS2, LEIXX, BIFLO, THEFY, NOCSJ } - определяемая группа: Mycobacteriales