Сравнение некоторых параметров белка THIE_BACSU с его ортологами

В качестве ортологов белка THIE_BACSU мной были выбраны белки THIE_BACCQ и THIE_BACHD. В данной таблице приведены результаты сравнений их по различным параметрам.

Некоторая информация о моем белке:

е)Какие ионы связываются с белком?

2 иона магния.

m)Получите последовательность 2-й альфа-спирали, используя команду seqret пакета EMBOSS.

После того, как мы узнали номера остатков конца и начало нашей спирали,
вводим команду seqret sw:thie_bacsu stdout -sbegin 21 -send 23. Таким образом, на экран выводится последовательность, в данном случае - SNN.

n)Получите последовательность 3-го бета-тяжа, используя команду seqret пакета EMBOSS.

В моем белке их нет(ввод команд производится аналогично пункту m).

o)Последовательности большинства белков начинаются с метионина. Почему? После биосинтеза в процессе созревания белка метионин может быть удален.
Указан ли метионин в начальной позиции заданного белка? А удаляется ли он потом?

Метионин кодируется у большинства организмов инициаторным кодоном, поэтому и стоит первым, мой белок также не исключение.

q)Предложите мутацию, которая, на Ваш взгляд, сильно повлияет на активность белка. Ответ требует краткого обоснования.

Одной из наиболее серьезных мутаций в белке, которая сильно снизит его активность - это мутация в области контакта лиганда и самого белка.
Достаточно заменить заряженные аминокислоты на аминокислоты с зарядом другого знака или нейтральные, белок потеряет способность связываться с лигандом.