A, B, Z формы ДНК


Описание расположения атомов цистеина в разных формах ДНК


Я исследовал 32-ой остаток (цистеин) в В-цепи.


Параметры спирали разных форм ДНК

 

A-форма

B-форма

Z-форма

Тип спирали (правая или левая)

Правая

Правая

Левая

Шаг спирали (A)

28,03

33,75

43,5

Число оснований на виток

11

10

12

Ширина большой бороздки

16,97 (G29:B.P - T15:A.P)

17,21 (C8:A.P - A30:B.P)

18,3 (C32:B.P - C6:A.P)

Ширина малой бороздки

7,98 (C28:B.P - T7:A.P)

11,69 (T7:A.P - A38:B.P)

9,87 (G15:A.P - C30:B.P)

Торсионные углы

  α β γ δ ε ζ χ
А-форма -51.69 174.79 41.68 9.08 147.8 -75.06 -157.18
В-форма -29,87 136,32 31,14 143.42 -140.77 -160.51 -97.95

Для исследования торсионных углов я исполизовал 32-ой остаток цитозина В-цепи.
Рассхождения с торсионными углами в презентации, довольно существенное.
Это может быть связано с тем, что в презентации описывались торсионные углы для гуанина(пуринового основания)
А я работал с цитозином(пиримидиновым основанием) => Разница в углах м.б. обусловлена разницей в стерических свойствах.

Главная страница (см. ниже)
©Abdullaev Eldar