| Метка поля | Содержание | |
|---|---|---|
| Код доступа | AC | P46327 |
| Идентификатор записи в БД | ID | YXBC_BACSU |
| Название (краткое описание) белка | DE | Полное название: белок yxbC с неизвестными функциями |
| Дата создания документа | DT | 01-NOV-1995 введен в базы данных: UniProtKB/Swiss-Prot |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 30-NOV-2010 |
| Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 3 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | MAR-2005 опубликована в PDB data bank |
| Ключевые слова | KW | 3D-структура; Полный протеом; Iron; Связывание металла; |
| Поле комментариев | CC | 1)Сходства с другими белками: в состав белка входит 1 JmjC домен 2)Ссылки на источник |
| Идентификаторы записей PDB | DR | 1VRB |
L E N V L A I(52-58aa моего белка)
Т.к. в описании моего белка не садержалось подходящей информации, а ключевые слова были
слишком общими, я задал предполжительную функцию моего белка "asparaginyl hydroxylase" и "Putative asparaginyl hydroxylase"
| Запрос | Число записей в SwissProt | Число записей в TrEMBL |
|---|---|---|
| Putative asparaginyl hydroxylase | 1 мой белок | 0 результатов |
| asparaginyl hydroxylase | 4 белка, включая мой | 0 результатов |
| Метка поля | Hypoxia-inducible factor 1-alpha inhibitor | Мой белок YXBC_BACSU | |
|---|---|---|---|
| Первый код доступа | AC | Q9NWI6 | P46327 |
| Идентификатор последовательности в БД | ID | HIF1N_HUMAN | YXBC_BACSU |
| Название (краткое описание) белка | DE | Основное название: Гипокси-индуцирующий фактор 1-альфа ингибитор, альтернативные названия: 1)Фактор ингибирующий HTF-1 2)Гипокси-индуцирующий фактор аспарагин гидроксилаза | Белок yxbC с неизвестными функциями |
| Дата создания документа | DT | 16-JUN-2003 | 01-NOV-1995 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 08-FEB-2011 | 30-NOV-2010 |
| Название организма | OS | Человек | Bacillus subtilis |
| Классификация организма (список таксонов) | OC |
|
|
| Длина последовательности | SQ | 349aa | 330аа |
| Молекулярная масса белка | SQ | 40285г/моль | 37458г/моль |
| Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 11 | 3 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | J. Biol. Chem. в 2003 году | В 2005 публикация в PDB data bank |
| Описание вторичной структуры | FT |
Helix- Спираль |
|
| Ключевые слова | KW | 3D-структура, ацетилирование, полный протеом, диоксигеназа, железо, связывание металла, ядро, оксидоредуктаза, полиморфизм, транскрипция, регуляция транскрипции | 3D-структура; Полный протеом; Железо; Связывание металла |
| Темы, освещённые в комментариях | CC | Функции белка, каталитическая активность, кофакторы, субъединицы, взаимодействия, внутриклеточное расположение, сходства | сходства с другими белками |
| Особенности последовательности | FT | В описании давалась подробная информация о вторичной структуре белка (см. выше) и номера аминокислот, входящих в состав различных структурных доменов белка. Из-за большого объёма информации я не стал приводить её здесь, из интересных особенностей нужно подчеркнуть наличие JmjC домена. | В состав белка входит JmjC домен |
| Идентификаторы записей PDB | DR | 1H2K не единственный | 1VRB |
Мой белок гораздо менее изучен чем другая аспарагин гидроксилаза, т. к. до сих пор точно не известна
функция, которую выполняет мой белок, также это
заметно по количеству
статей об аспарагин гидроксилазе человека. Из сходств между белками нужно отметить:
примерно одинаковую длину аа последовательности => равный размер, наличие JmjC домена и связанные с белком ионы железа.
Вероятно, все перечисленные сходства вызваны тем, что оба фермента
выполняют одинаковые функции.