Описание субъединицы CarD комплекса кофеил-КоА-редуктазы и Etf из генома бактерии Acetobacterium woodii DSM 1030.
Информация о белке
Все данные были получены из базы NCBI с помощью поиска по идентификатору белка в разделе Protein. Последовательность белка была оформлена в виде fasta-файла (кодировка - ASCII, кодировка концов строк - Unix, ширина строки - 60 символов). Файл доступен для скачивания.
| Идентификатор белка | AFA48355.1 |
|---|---|
| Идентификатор генома | CP002987.1 |
| Название белка | Caffeyl-CoA reductase-Etf complex subunit CarD |
| Координаты гена в геноме | 1858307..1859095 |
| Длина гена (п.н.) | 789 |
| Цепь | прямая |
| Длина белка (а.о.) | 262 |
Бактерия Acetobacterium woodii DSM 1030 использует этот комплекс для флавин-завивисимого разделения потоков электронов, необходимого для эндергонического восстановления феррекдоксина при помощи NADH.
Геномное окружение белка
Представленное ниже изображение также получено с помощью геномного браузера NCBI. Рассматриваемый ген расположен внизу и в центре. Соседние гены кодируют субъединицы CarC (AFA48354.1) и CarE (AFA48356.1) того же белкового комплекса. Их окружают кофеил-КоА-синтетаза (AFA48353.1) и неописанный белок (AFA48357.1). Все они закодированы на прямой цепи.
Красными полосами показаны различные гены, направление считывания белков определяется по белым стрелкам. Светло-серые полосы вверху обозначают открытые рамки считывания. Другие возможные рамки выделены с помощью цветных указателей: зеленые палочки - старт-кодоны, а красные - стоп-кодоны.