Главная Семестры Обо мне

Мембранные белки

Буду неоригинальна, но я сейчас в своей лабе занимаюсь эволюцией коронавирусов, так что оно прямо напрашивалось...

Ангиотензинпревращающий фермент-2 - это мембранный белок, экзопептидаза, катализирующая гидролиз ангиотензина II в ангиотензин (1-7). Первый энзим является вазоконстриктором, второй - вазодилататором, т.е. наш белок понижает кровяное давление. А знаете где его много? Правильно, в альвеолярных клетках, где за эти белки счастливо цепляются S-белки. Сейчас ученые и врачи по всему миру предпринимают попытки (пока что безуспешные) использовать накопленные из-за связи этого фермента с сердечно-сосудистыми заболеваниями знания для лечения коронавируса.

something went wrong
Рисунок 1. Предсказание TMHMM

Получается не особо интересно. Основная часть белка расположена снаружи клетки, есть только одна трансмембранная альфа-спираль и совсем короткий участок в цитоплазме. Однако эта информация совпадает с представленной в RCSB.

something went wrong
Рисунок 2. Описание структуры

Самое время прерваться на любование толстым енотом, который выглядит прямо как смотрящая со страданием на новые двадцать два примера по диффурам я на карантине:

something went wrong
Рисунок 3. В меру упитанный енот

После эмоциональной разгрузки можно вернуться к нашему белку. Предсказание и описание - это классно, но хочется посмотреть, как он выглядит!

something went wrong
Рисунок 4. Комплекс ACE2-B0AT1

На рисунке внешний участок фермента покрашен голубым цветом, трансмембранный - алым, а внутренний - зеленым. Серый белок - один из транспортеров нейтральных аминокислот через мембрану - показан для удобства ориентации.

Следующая структура включает, к сожалению, только внешнюю часть фермента, покрашенную в тот же цвет, что и ранее, но показывает взаимодействие с белком вируса (алый), ответственным за его проникновение в клетку.

something went wrong
Рисунок 5. Комплекс ACE2-SARS-2 spike protein