Альфа-спираль цепи E(268-287).

Изображение спирали:

Пункт 1.

Торсионные углы между остатками спирали.

Сравнение значений торсионных углов в спирали.

Пункт 2.

Изображение водородных связей в спирали.Всего в спирали 17 водородных связей.


Водородные связи возникают между:



Cравнивая две таблицы, можно заметить, что водородные связи возникают между атомами азота и кислорода остатков в основном с порядковыми номерами, отличающимися на 4.Например, между азотом из Asp 280 и кислородом из Gly 276.(Такие остатки выделены в таблицах красным и синим цветами). Также можно заметить, что иногда атом остатка образует 2 водородные связи( бордовый и темно-синий цвета соответственно),при этом разница между номерами остатков в двух случаях из трех равна 3,а не 4.

Пункт 3.
Контакты альфа-спирали 268-287 с остальной частью цепи E белка из записи PDB 1E94.

Первый семестр.Результаты упражнений

©Александра Литвинчук,2007