Описание белка с неизвестной функцией (предположительно глюкоамилазы) из генома бактерии Acetobacter pasteurianus NBRC 101655

Последовательность белка:

>BAU39574.1 hypothetical protein
MKTKCVPDVWKNKKPDLSEKRKSFLKTGALLLAGSLFLGVANISGQAYALAPSAQAPQAYTPTPAD
VAMVSDLEQRTFQWFWDSADPATGLIPDRYPSDQKQDSVASVGFGLTAYGIGVKRHYITRQQAVER
TLTTLRYMWKLPQNESADKASGYHGFFYHFLDNRTGLRLNPDIELSSIDTALLMQGVLFCRNFYTQ
DTAQEKEIRQLSDQLFNRVDWKWMERPDHRLSMGWSPEHGFLPNYWEGYSEGMMLYILALGTPEHG
LQPVSWQAWLATNDKRWGEEYGQTFLNFAPLFGHQYSHAWIDFRGIQDNWISSKGIDYFENSRRAV
YAQRNYAVSNPGKWQGYDANTWGLTASDGPGDVTKTENGQTRHFLSYSARGVGRDYTQDDGTIAPT
AAGGSVAFAPEIAIPALRTMKSKYGNHIYGKYGFADSFNPSFHDEKQDYWADNTYLGIDQGPILLM
VENWRSGFVWDTMRQSAVIRRGLLQAGFHGGWLQQVAQQPSSVVRRKG

Таблица 1. Описание белка с неизвестной функцией из генома бактерии Acetobacter pasteurianus NBRC 101655

Идентификатор белка BAU39574.1
Идентификатор генома AP014881.1
Название белка (на англ. языке) hypothetical protein (putative glucoamylase)
Координаты гена в геноме 2711856..2713388
Длина гена (в парах нуклеотидов) 1533 п.н.
Цепь (прямая или обратная) обратная
Длина белка (в аминокислотных остатках) 510 а.о.

Геномное окружение гена изучаемого белка

Рисунок 1. Геномное окружение гена белка с неизвестной функцией (предположительно глюкоамилазы) (идентификатор белка - BAU39574.1) Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI.

Красными полосками изображены гены, направление стрелок на них указывает на то, с какой цепи считывался белок (в моем случае стрелки направлены влево, а значит выданный мне белок закодирован с обратной цепи). Выше находятся открытые рамки считывания(серые полоски).Те, что изображены в строке "+1",кодируют белок, начиная с первого нуклеотида после старт-кодона, в строке "+2" - со второго, в строке "+3" - с третьего. Рамки считывания обратной цепи находятся в строках "-1","-2","-3". Моему белку соответствует рамка считывания в строке "-2". Красными черточками изображены стоп-кодоны, зелеными - старт-кодоны.