Банк EMBL

Сравнение разных записей в EMBL

Идентификатор записи EMBL	Тип молекулы	Класс данных	Раздел EMBL	Дата создания документа	Описание	Длина последовательности
U00096	genomic DNA	STD	PRO	23 февраля 2006	Escherichia coli K12 MG1655, complete genome.	4639675
AP009048	genomic DNA	STD	PRO	22 января 2006	Escherichia coli W3110 DNA, complete genome.	4646332
L19201	genomic DNA	STD	PRO	31 августа 1993	E. coli chromosomal region from 87.2 to 89.2 minutes.	96484


STD означает, что записи стандарты.
PRO означает, что последовательности взяты из прокариотной ДНК.

Сравнение описаний гена Escherichia coli в двух разных записях EMBL

Для дальнейшего изучения были выбраны U00096 и L19201 записи банка EMBL:

Последовательности, кодирующие белок HSLU_ECOLI в двух записях банка EMBL

	I	II
ID записи	U00096	L19201
Начало гена в записи	4118439	82049
Конец гена в записи	4119770	83380
Направление гена	обратное	обратное




Упомянутые последовательности, кодирующие белок HSLU_ECOLI, совпадают на 100% (выравнивание).


Знакомство с записью гена из эукариотического генома

• Схема структуры транслируемых участков гена MPG.

  Ген на прямой цепи:

  --[69292..69333]--...--[75400..75776]--->

• Общее число экзонов в гене: 4
  Длина самого длинного экзона составляет 377 bp, самого короткого - 42.
  Длина самого длинного интрона - 3353, самого короткого - 92.