Практикум 1

Отобраные бактерии

Отобраные бактерии
Acidothermus cellulolyticus ACIC1
Bifidobacterium longum BIFLO
Clavibacter michiganensis CLAMS
Corynebacterium efficiens COREF
Mycolicibacterium vanbaalenii MYCVP
Nocardioides sp. NOCSJ
Streptomyces avermitilis STRAW
Thermobifida fusca THEFY

Скобочная формула дерева

(((((STRAW,THEFY),ACIC1),NOCSJ),(CLAMS,BIFLO)),(MYCVP,COREF))

Изображение дерева

Нетривиальные ветви

  • {STRAW,THEFY} против {ACIC1,NOCSJ,CLAMS,BIFLD,MYCVP,COREF}
  • {STRAW,THEFY,ACIC1} против {NOCSJ,CLAMS,BIFLD,MYCVP,COREF}
  • {STRAW,THEFY,ACIC1,NOCSJ} против {CLAMS,BIFLD,MYCVP,COREF}
  • {STRAW,THEFY,ACIC1,NOCSJ} против {CLAMS,BIFLD}
  • {STRAW,THEFY,ACIC1,NOCSJ,CLAMS,BIFLD} против {MYCVP,COREF}
  • Таксоны

    Таксоны бактерий
    ACIC1 cellular organisms Bacteria Terrabacteria group Actinomycetota Actinomycetes Acidothermales Acidothermaceae Acidothermus
    BIFLO cellular organisms Bacteria Terrabacteria group Actinomycetota Actinomycetes Bifidobacteriales Bifidobacteriaceae Bifidobacterium
    CLAMS cellular organisms Bacteria Terrabacteria group Actinomycetota Actinomycetes Micrococcales Microbacteriaceae Clavibacter
    COREF cellular organisms Bacteria Terrabacteria group Actinomycetota Actinomycetes Mycobacteriales Corynebacteriaceae Corynebacterium
    MYCVP cellular organisms Bacteria Terrabacteria group Actinomycetota Actinomycetes Mycobacteriales Mycobacteriaceae Mycolicibacterium
    NOCSJ cellular organisms Bacteria Terrabacteria group Actinomycetota Actinomycetes Propionibacteriales Nocardioidaceae Nocardioides
    STRAW cellular organisms Bacteria Terrabacteria group Actinomycetota Actinomycetes Kitasatosporales Streptomycetaceae Streptomyces
    THEFY cellular organisms Bacteria Terrabacteria group Actinomycetota Actinomycetes Streptosporangiales Nocardiopsaceae Thermobifida

    Ветви и отделяемые группы

  • {STRAW,THEFY} против {ACIC1,NOCSJ,CLAMS,BIFLD,MYCVP,COREF}. Тут интересно что,у STRAW и THEFY после Actinomycetes идут разные группы,но они в одной ветви.Как оказалось Kitasatosporales для STRAW отделили только в конце 2022 года, до этого она была в Streptosporangiales как и THEFY
  • {STRAW,THEFY,ACIC1} против {NOCSJ,CLAMS,BIFLD,MYCVP,COREF}
  • {STRAW,THEFY,ACIC1,NOCSJ} против {CLAMS,BIFLD,MYCVP,COREF}.Тут ситуация похожа на то что выше, поэтому далее я не буду обращать внимание на STRAW,а то она все ломает.Однако мне снова повезло попасть на ветку с большим количеством относительно свежих изменений, так как оказалось Nocardiopsaceae,Nocardioidaceae и Acidothermaceae очень близкие группы.
  • {STRAW,THEFY,ACIC1,NOCSJ} против {CLAMS,BIFLD}
  • {STRAW,THEFY,ACIC1,NOCSJ,CLAMS,BIFLD} против {MYCVP,COREF}.{MYCVP,COREF} отделены по Mycobacteriales