Краткое описание археи Vulcanisaeta moutnovskia
Vulcanisaeta moutnovskia — это анаэробная гетеротрофная гипертермофильная архея, живущая при температуре 85-90 °C и pH 4.0-4.5. Обычно обитает в серных озерах и геотермальных источниках. В отличие от схожих архей Thermocladium или Caldivirga, Vulcanisaeta растет в отсутствии витаминной смеси или раствора экстракта клеток архей в окружающей среде. Также, в отличие от схожих архей, которые распространены по всему миру, Vulcanisaeta была найдена только в Японии [1].
У археи одна хромосома, размер генома составляет 2298983 нуклеотидных пар. В нем находятся 2393 гена. Геном был секвенирован 6-го июля 2013-го года [2].
Из гистограммы в таблице 1 видно, что для археи наиболее типичны белки длиной 100-400 аминокислот.
Таблица 1. Histogram of protein lengths in Vulcanisaeta moutnovskia 768-28 chromosome, complete genome — 1..2298983:
| Range | Count |
|---|---|
| 1..100 | 256 |
| 101..200 | 617 |
| 201..300 | 517 |
| 301..400 | 430 |
| 401..500 | 247 |
| 501..600 | 128 |
| 601..700 | 66 |
| 701..800 | 24 |
| 801..900 | 15 |
| 901..1000 | 8 |
| >1000 | 12 |
| Total | 2320 |
Рисунок 1. Архея Vulcanisaeta.
Краткое описание белка c идентификатором YP_004245953.1
Источники:
[1] — Vulcanisaeta, Wikipedia.
[2] — Vulcanisaeta moutnovskia, Genome, NCBI.