Построение парных выравниваний. Поиск по сходству
1. Выборка гомологов белка с идентификатором WP_013605612.1
Число находок: 26.
Число находок с query cover > 80%: 26.
Лучшая находка
Длина выравнивания: 314.
Bit score: 348 bits.
Positives: 70%.
Identities: 52%.
E-value: 2e-119.
The alignmentХудшая находка
Длина выравнивания: 350.
Bit score: 82 bits.
Positives: 46%.
Identities: 23%.
E-value: 2e-16.
The alignmentНаходка из середины списка
Длина выравнивания: 350.
Bit score: 89.4 bits.
Positives: 43%.
Identities: 25%.
E-value: 5e-19.
The alignment2. Множественное выравнивание последовательностей из полученной выборки
На N-конце присутствует достаточно длинный невыровненный участок, различный у разных находок. На C-конце такой участок относительно короткий.
Рисунок 1. Множественное выравнивание последовательностей из полученной выборки.
4. Выровненные глобальное и локальное парные выравнивания белка с идентификатором WP_013605612.1 и худшей находки из выборки
Участок, найденный программами BLAST и water, не совпадает. Есть участки, на которых выравнивания различаются.
Рисунок 2. Один участок , где хотя бы два выравнивания различны.
Рисунок 3. Выравнивания по группам: глобальное (выданное needle), глобальное (полученное из множественного), локальное (выданное water), локальное (выданное BLAST).
5. Парные выравнивания последовательностей двух заведомо негомологичных белков
Нет участков, на которых выравнивания различаются.
Рисунок 4. Выравнивания по группам: глобальное (выданное needle), локальное (выданное water).