Построение парных выравниваний. Поиск по сходству
1. Выборка гомологов белка с идентификатором WP_013605612.1
Число находок: 26.
Число находок с query cover > 80%: 26.
Лучшая находка
Длина выравнивания: 314.
Bit score: 348 bits.
Positives: 70%.
Identities: 52%.
E-value: 2e-119.
The alignmentХудшая находка
Длина выравнивания: 350.
Bit score: 82 bits.
Positives: 46%.
Identities: 23%.
E-value: 2e-16.
The alignmentНаходка из середины списка
Длина выравнивания: 350.
Bit score: 89.4 bits.
Positives: 43%.
Identities: 25%.
E-value: 5e-19.
The alignment2. Множественное выравнивание последовательностей из полученной выборки
На N-конце присутствует достаточно длинный невыровненный участок, различный у разных находок. На C-конце такой участок относительно короткий.
![Many](many.png)
Рисунок 1. Множественное выравнивание последовательностей из полученной выборки.
4. Выровненные глобальное и локальное парные выравнивания белка с идентификатором WP_013605612.1 и худшей находки из выборки
Участок, найденный программами BLAST и water, не совпадает. Есть участки, на которых выравнивания различаются.
![Many](chunk.png)
Рисунок 2. Один участок , где хотя бы два выравнивания различны.
![Combo](combo.png)
Рисунок 3. Выравнивания по группам: глобальное (выданное needle), глобальное (полученное из множественного), локальное (выданное water), локальное (выданное BLAST).
5. Парные выравнивания последовательностей двух заведомо негомологичных белков
Нет участков, на которых выравнивания различаются.
![Nohomo](nohomo.png)
Рисунок 4. Выравнивания по группам: глобальное (выданное needle), локальное (выданное water).